ЛАБОРАТОРИЯ ПОСТГЕНОМНЫХ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ

Лаборатория постгеномных молекулярно-генетических исследований

Заведующий - д.б.н., проф. Носиков Валерий Вячеславович

Телефон: (495) 939-71-92

 

Носиков Валерий Вячеславович, в 1967 г. окончил кафедру химии природных соединений химического факультета МГУ, д.б.н. с 2003 г.,  профессор с 2006 г. С 1967 г. по 1986 г. работал в Институте молекулярной биологии АН СССР. С 1986 г. по 2009 г. работал в ФГУП “ГосНИИ генетика” в должности заведующего лабораторией молекулярной диагностики и геномной дактилоскопии. С 2009 г. работает в ИБХФ РАН в должности заведующего лабораторией. С 1993 по 1995 г.г. В.В. Носиков был в командировке в отделе биохимии Университета штата Миссури, в этом отделе он работал в качестве приглашенного профессора. Носиков В.В. – один из авторов  работы  по определению полной первичной структуры цитоплазматической аспартат-аминотрансферазы, в 1975 г. за участие в этой работе ему была присуждена премия Ленинского комсомола.  Области научных интересов В.В. Носикова – молекулярная генетика сахарного диабета типа 1 и 2, а также поздних осложнений диабета. Еще одной областью научных интересов В.В. Носикова является изучение генетической предрасположенности к сердечно-сосудистым заболеваниям.

 

Основные направления исследований

 

  • Основным направлением исследований лаборатории является проведение фундаментальных научных исследований в области полиморфизма генома человека и генетической предраспо­ложен­ности к широко распростра­ненным, многофакторным заболеваниям человека.
  • Изучение ассоциации полиморфных маркеров генома человека с сахарным диабетом типа 1 и 2, а также поздними осложнениями диабета.
  • Изучение ассоциации полиморфных маркеров генома человека с сердечно-сосудистыми заболеваниями (инфаркты, тромбозы, и ряд других).
  • Разработка наборов на основе полиморфных мини- и микросателлитов, которые используются для идентификация личности, установления спорного отцовства и криминалистической экспертизы.

 

Основные научные направления лаборатории возникли еще в ФГУП “ГосНИИ генетика” в 90-е годы, когда были начаты систематические исследования в области полиморфизма генома человека и генетической предраспо­ложен­ности к широко распростра­ненным, многофакторным заболеваниям человека. К настоящему времени выявлены генетические факторы риска, определяющие предрасположенность к сахарному диабету типа 1 и типа 2 у больных русского происхождения.

Также выявлены основные гены, ассоциированные с диабетическими нефро- и нейропатиями у больных сахарным диабетом типа 1. Следует отметить, что с  диабетической нейропатией у больных сахарным диабетом типа 1 ассоциированы в основном гены, связанные с инактивацией свободных радикалов и перекисей, а также с процессами репарации.

Интересные результаты получены также при изучении генетических факторов в оценке риска у больных, перенесших острый коронарный синдром. В этом случае применение современных методов математической обработки данных, основанное на Байесовских сетях доверия, позволяет создать прогностическую модель высокой точности, которая при расчете индивидуального риска учитывает значительное число параметров конкретного больного.

В течение многих лет нами определялись частоты аллелей ряда полиморфных мини- и микросателлитов. В результате этих исследований разработаны наборы на основе полиморфных мини- и микросателлитов, которые используются для идентификация личности, установления спорного отцовства и криминалистической экспертизы.

 

Состав лаборатории

 

Носиков Валерий Вячеславович, зав. лаб., д.б.н., профессор;

Брага Элеонора Александровна, с.н.с., д.б.н., профессор;

Ефремов Илья Алексеевич, с.н.с., к.б.н.;

Никитин Алексей Георгиевич, с.н.с., к.б.н.;

Бурденный Алексей Михайлович, н.с., к.б.н.

 

15 избранных публикаций

 

Chistiakov, D.A., Potapov, V.A., Khodirev, D.S., Shamkhalova, M.S., Shestakova, M.V., Nosikov, V.V. (2010) Replication of association between polymorphisms of the pancreatic ATP-sensitive potassium channel and susceptibility to type 2 diabetes in two Russian urban populations. Central European Journal of Biology, 5(1), 67–77.

 

Chistiakov, D.A., Khodyrev, D.S., Smetanina, S.A., Bel'chikova, L.N., Suplotova, L.A., Nosikov, V.V. (2010) A WFS1 haplotype consisting of the minor alleles of rs752854, rs10010131, and rs734312 shows a protective role against type 2 diabetes in Russian patients. The Review of Diabetic Studies, 7(4), 285-292.

 

Zateyshchikov, D.A., Brovkin, A.N., Chistiakov, D.A., Nosikov, V.V. (2010) Advanced age, low left atrial appendage velocity, and Factor V promoter sequence variation as predictors of left atrial thrombosis in patients with nonvalvular atrial fibrillation. J. Thromb. Thrombolysis, 30(2), 192-199.

 

Никитин, А.Г., Лаврикова, Е.Ю., Серегин, Ю.А., Зильберман, Л.И., Цитлидзе, Н.М., Кураева, Т.Л., Петеркова, В.А., Дедов И.И., Носиков, В.В. (2010) Ассоциация полиморфных маркеров генов ERBB3 и SH2B3 с сахарным диабетом типа 1. Молекулярная биология, 44(2), 257-262.

 

Nikitin, A.G., Chistiakov, D.A., Minushkina, L.O., Zateyshchikov, D.A., Nosikov, V.V. (2010) Association of the CYBA, PPARGC1A, PPARG3, and PPARD gene variants with coronary artery disease and metabolic risk factors of coronary atherosclerosis in a Russian population. Heart Vessels, 25(3), 229-236.

 

Потапов, В.А., Шамхалова, М.Н., Сметанина, С.А., Бельчикова, Л.Н., Суплотова, Л.А., Шестакова, М.В., Носиков, В.В. (2010) Полиморфные маркеры rs12255372 и rs13266634 генов TCF7L2 и SLC30A8 связаны с развитием сахарного диабета типа 2  в русской популяции. Генетика, 46(8), 1123-1231.

 

Lavrikova, E.Y., Nikitin, A.G., Kuraeva, T.L., Peterkova, V.A., Tsitlidze, N.M., Chistiakov, D.A., Nosikov, V.V. (2011) The carriage of the type 1 diabetes-associated R262W variant of human LNK correlates with increased proliferation of peripheral blood monocytes in diabetic patients. Pediatric Diabetes, 12(2), 127-132.

 

Chistiakov, D.A., Potapov, V.A., Smetanina, S.A., Bel’chikova, L.N., Suplotova, L.A., Nosikov, V.V. (2011) The carriage of risk variants of CDKAL1 impairs beta-cell function in both diabetic and non-diabetic patients and reduces response to non-sulfonylurea and sulfonylurea agonists of the pancreatic KATP channel. Acta Diabetology, 48(3), 227-235.

 

Пушков, А.А., Благодатских, К.А., Никитин, А.Г., Агапкина, Ю.В., Бровкин, А.Н., Чудакова, Д.А., Евдокимова, М.А., Асейчева, О. Ю., Осмоловская, В.С., Минушкина, Л.О., Бакланова, Т.Н., Талызин, П.А., Донецкая, О.П., Терещенко, С.Н., Джаиани, Н.А., Акатова, Е.В., Глезер, М.Г., Галявич, А.С., Закирова, В.Б., Казиолова, Н.А., Ягода, А.В., Боева, О.И., Хоролец, Е.В., Шлык, С.В., Волкова, Э.Г., Маргарян, М.П., Гузь, И.О., Константинов, В.О., Тимофеева, И.В., Сидоренко, Б.А., Затейщиков, Д.А., Носиков, В.В. (2011) Полиморфные маркеры Ala455Val гена THBD и Arg353Gln гена F7 и осложнения атеросклероза у больных, перенесших острый коронарный синдром. Генетика, 47(10), 1386 – 1392.

 

Никитин, А.Г., Серегин, Ю.А., Носиков, В.В. (2011) Молекулярно-генетический анализ предрасположенности к сахарному диабету типа 1. Вкн: «Введение в молекулярную диагностику», Т. 2, стр. 361 – 383. М.: ОАО «Издательство “Медицина”», Под ред. академика РАН и РАМН М.А. Пальцева и Д.В. Залетаева.

 

Сахарный диабет: диагностика, лечение, профилактика. Дедов И.И., Шестакова М.В., Андреева Е.Н., Беловалова И.М., Викулова О.К., Галицина Н.А., Галстян Г.Р., Григорян О.Р., Емельянов А.О., Зильберман Л.И., Кандрор В.И., Кононенко И.В., Кураева Т.Л., Майоров А.Ю., Маслова О.В., Мельникова О.Г., Мотовилин О.Г., Никитин А.Г., Никонова Т.В., Носиков В.В. и др. под редакцией И.И. Дедова, М.В. Шестаковой. Москва, 2011.

 

Chistiakov, D.A., Nikitin, A.G., Smetanina, S.A., Bel’chikova, L.N., Suplotova, L.A., Shestakova, M.V., Nosikov, V.V. (2012) The rs11705701 G>A polymorphism of IGF2BP2 is associated with IGF2BP2 mRNA and protein levels in the visceral  adipose tissue - a link to type 2 diabetes susceptibility. The Review of Diabetic Studies, 9 (2), 105 – 115.

 

Dubinina, I.A., Chistiakov, D.A., Eremina, I.A., Brovkin, A.N., Zilberman, L.I., Nikitin, A.G., Kuraeva, T.L., Nosikov, V.V., Peterkova, V.A., Dedov, I.I. (2014) Studying progression from glucose intolerance to type 2 diabetes in obese children. Diabetes Metab. Syndr., 8 (3), 133137.

 

Babizhayev, M.A., Strokov, I.A., Nosikov, V.V., Savel'yeva, E.L., Sitnikov, V.F., Yegorov, Y.V., Lankin, V.Z. (2014) The Role of Oxidative Stress in Diabetic Neuropathy: Generation of Free Radical Species in the Glycation Reaction and Gene Polymorphisms Encoding Antioxidant Enzymes to Genetic Susceptibility to Diabetic Neuropathy in Population of Type I Diabetic Patients. Cell Biochem Biophys. Nov 27. [Epub ahead of print].

 

Maslennikov, E.D., Sulimov, A.V., Savkin, I.A., Evdokimova, M.A., Zateyshchikov, D.A., Nosikov, V.V., Sulimov, V.B. (2015) An intuitive risk factors search algorithm: usage of the Bayesian network technique in personalized medicine. Journal of Applied Statistics, 42, 71–87.

 

Публикации сотрудников лаборатории посмтгеномных молекулярно-генетических исследований за 2015 год (зав. лаб. В.В. Носиков)

 

- опубликованные статьи:

 

Отечественные журналы

  1. Никитин А.Г. Потапов В.А., Бровкин А.Н., Лаврикова Е.Ю., Ходырев Д.С., Шамхалова М.Ш., Сметанина С.А., Суплотова Л.Н., Шестакова М.В., Носиков В.В., Аверьянов А.В. (2015) Ассоциация полиморфных маркеров генов FTO, KCNJ11, SLC30A8 и CDKN2B с сахарным диабетом типа 2. Молекулярная биология, 49(1), 119 – 128.

  2. Мартиросян Н.С., Бурденный А.М., Трухина Л.В., Пантелеева О.Г., Саакян С.В., Петунина Н.А., Носиков В.В. (2015) Ассоциация полиморфных маркеров генов CTLA4 и TNF с эндокринной офтальмопатией у пациентов русского происхождения с болезнью Грейвса. Терапевтический архив, 87(10), 67-71.

 

Иностранные журналы

1.Maslennikov, E.D., Sulimov, A.V., Savkin, I.A., Evdokimova, M.A., Zateyshchikov, D.A., Nosikov, V.V., Sulimov, V.B. (2015) An intuitive risk factors search algorithm: usage of the Bayesian network technique in personalized medicine. Journal of Applied Statistics, 42, 71–87.

ЛАБОРАТОРИЯ НЕЙРОХИМИИ

Лаборатория нейрохимии
Заведующий - д.б.н. Каламкаров Григорий Рафаэлевич
Телефон: 939-74-05

 

В ИХФ, затем - в ИБХФ с 1974 г. Работал в лаборатории физико-химических основ рецепции (зав. лаб. академик Островский М.А.) Специалист в области молекулярных механизмов сенсорной трансдукции. Совместно с академиком Островским участвовал в расшифровке аминокислотной последовательности зрительного белка родопсина – первого трансмембранного белка, первичная структура которого была  определена. Впервые было установлено, что  фоторецепторная мембрана диска отличается крайне низкой проводимостью, что свидетельствует о том, что она не содержит ионных каналов (FEBS Lett. -1980, Eur.J. Biochemistry. – 1981). В серии работ была выявлена ключевая роль рН в регуляции процессов фототрансдукции в палочках сетчатки (J. Physiology. – 1990,Vision Research. – 1994,1996.)  Впервые обнаружены регулирумые циклическими нуклеотидами ионные каналы в кохлеарных волосковых клетках и показано, что их проводимость регулируется при участии сульфгидрильных групп (Exp. Eye Res. – 1990, FEBS Lett. – 1991).

С 2005 г. руководит лабораторией нейрохимии.  Основным направлением работы лаборатории  является изучение химических механизмов гибели нервных клеток при развитии патологии или  в экстремальных условиях. Поиск перспективных соединений для лечения и профилактики этих заболеваний. Поиск новых методов диагностики патологий сетчатки глаза (ишемия, диабетическая ретинопатия, увеиты и др.) и неврологических расстройств (рассеянный склероз).

В работах лаборатории установлено, что оксид азота является необходимым  и ключевым элементом развития апоптотической гибели клеток сетчатки при фотоповреждении и развитии ишемии.  Показано, что при развитии острой ишемии и инфаркта сетчатки  происходит восстановление нитритов до оксида азота, что играет важную протекторную роль. Искусственное увеличение концентрации нитритов в сосудах предотвращает развитие тромбоза (Биофизика. - 2010, 2012). Установлена важная роль оксида азота при дегенерации мышечных клеток в условиях разгрузки (Acta Astronautica. - 2011, PLoS One.  – 2014).  На основе выделенных их сетчатки антигенов разработан новый иммунологический метод ранней диагностики офтальмологических заболеваний – диабетической ретинопатии, ретинитов,  увеитов, диагностики отдаленных последствий травм глаза. Разработан метод диагностики обострений рассеянного склероза по выявлению в крови больных специфических антител. Метод защищен патентами и используется в медицинской практике российских офтальмологических центров.

 

Основные направления научной деятельности лаборатории:

Химические механизмы действия оксида азота в работе нервных клеток и  при нейродегенерации.

Нейропротекторное и нейротоксическое действие оксида азота в клетках сетчатки глаза.

Свободнорадикальные процессы в нервных клетках мозга и сетчатки глаза

Химические механизмы синаптической передачи в сетчатке глаза.

Молекулярные механизмы развития ишемии мозга и сетчатки и поиск перспективных соединений для  защиты от ишемического повреждения.

Создание новых методов диагностики патологий сетчатки на основе антигенов.

Состав лаборатории:

Аболтин Павел Валерьевич м.н.с., к.б.н.

Бугрова Анна Евгеньевна с.н.с., к.б.н.

Каламкаров Григорий Рафаэлевич, зав. лаб., д.б.н.,

Константинова Татьяна Васильевна, н.с., к.б.н.,

Шевченко Татьяна Федоровна, с.н.с.,к.б.н.

 

Список трудов

L.A. Drachev, A.D. Kaulen, G.R. Kalamakarov, M.A. Ostrovskii, V.P Skulachev.  Fast stages of photoelectric processes in biological membrane.II.Visual rhodopsin // Eur.J. Biochemistry. – 1981. - V.117. – P. 471-481.

Donner, S. Hemila, A. Koskelainen, T. Shevchenko, G. Kalamkarov. Rod phototransduction modulated by bicarbonate in the frog retina: roles of carbonic anhydrase and bicarbonate exchange. // J. Physiology. – 1990. – V. 426(1). – P. 297-316.

S.S. Kolesnikov, T.I. Rebrik, А.В.Zhainazarov, G.A.Tavartkiladze, G.R. Kalamkarov. A cyclic-AMP-gated conductance  in cochlear hair cells. FEBS Lett. – 1991. - V.290. – P. 167-170

Donner, G.R. Kalamkarov, A. Koskelainen, S.Hemila. Changes in the light-sensitive current of salamander  rods  upon manipulation of putative pH-regulating mechanisms in the inner and  outer  segment. // Vision Research. – 1994. - V. 34(8). – P. 983-994.

G.R. Kalamkarov, I.D. Pogozheva, T.F. Shevchenko, K. Donner, A. Koskelainen, S. Hemila. pH changes in frog retina upon manipulation of putative pH-regulating transport mechanisms. // Vision Research. – 1996. - V. 36(19). – P. 3029-3036.

Каламкаров Г.Р., Островский М.А. Молекулярные механизмы зрительной трансдукции. -  Монография. -  Изд. «Наука», Москва. – 2002.

V.S. Kurova, I.N. Kurochkin, G.R. Kalamkarov, A.E. Bugrova, K.Yu. Fedortchenko, S.D. Varfolomeev. Structural and catalytic polymorphism of human enzymes. Novel potential platforms for biomedical diagnostics. // Biotechnol Adv. - 2009. – V. 27. № 6. – P. 945-959.

Каламкаров Г.Р., Константинова Т.С., Бугрова А.Е., Шевченко Т.Ф., Цапенко И.В., Зуева М.В., Иванов А.Н. Нитриты могут восстанавливаться в ретинальных сосудах при гипоксии и защищать сетчатку от ишемии и апоптоза. // Биофизика. - 2010. - Т. 55. - №4. - С.687-694

Kartashkina, Y. Lomonosova, A.E. Bugrova, O.V. Turtikova, G.R. Kalamkarov, T.L. Nemirovskaya. Prevention of muscle fibers atrophy during gravitational unloading: The effect of L-arginine administration. // Acta Astronautica. - 2011. - V. 68. - N 9-10. - P.1486-1494

Нероев В.В., Зуева М.В., Каламкаров Г.Р. // Молекулярные механизмы ретинальной ишемии. Вестник офтальмологии. – 2010. - Т.126. - №3. – С. 59-62.                                

Константинова Т.С., Бугрова А.Е., Шевченко Т.Ф., Ванин А.Ф., Каламкаров Г.Р. Изменение содержания оксида азота регулирует развитие апоптоза в сетчатке глаза // Биофизика. - 2012. - Т.57. - Вып.2. - С. 325-330.

Ломоносова Ю.Н., Каламкаров Г.Р., Бугрова А.Е.,  Шевченко Т.Ф, Карташкина Н. Л., Лысенко Е.А., Шенкман Б.С., Немировская .Т. Л. Роль NO-синтазы в регуляции белкового метаболизма растянутой m. Soleus крыс при функциональной разгрузке // Биохимия. -2012. - Т.77. - №2. - С. 256-266.                       

 

П.П. Левин, П.В. Аболтин, Т.С. Константинова, Т.Ф. Шевченко, Г.Р. Каламкаров.

Исследование спектрально-кинетических характеристик  триплетного состояния полностью транс-ретиналя в водных растворах ретиналь-связывающих белков и липосом  методом лазерного фотолиза // Химия высоких энергий. - 2013. - Т. 47. - № 3. - С. 1–4.                                                                                               

 

П.В. Аболтин, Т.Ф. Шевченко, К.Б. Шумаев, Г.P. Каламкаpов. Фотоиндуцированная генерация активных форм кислорода производными и конъюгатами ретиналя // Биофизика. - 2013. - Т. 58. - Вып. 2. - С. 246–251.

Г.Р. Каламкаров, А.Е. Бугрова, Т.С. Константинова, Т.Ф. Шевченко. Эндогенное содержание оксида азота в клеточных слоях сетчатки глаза // Российский физиологический журнал им. И.М. Сеченова. - 2014. - Т. 100. - № 7. - С. 852-860.

Lomonosova Y.N., Shenkman B.S., Kostrominova T.Y., Nemirovskaya T.L., Kalamkarov G.R. L-arginine supplementation protects exercise performance and structural integrity of muscle fibers after a single bout of eccentric exercise in rats.  // PLoS One.  – 2014. - V. 9. -№4. - P e94448.

 

Публикации сотрудников лаборатории нейрохимии за 2015 год (зав. лаб. Г.Р. Каламкаров)

 

- опубликованные и поданные в печать статьи в монографиях, сборниках трудов:

 

Г.Р. Каламкаров, А.Е. Бугрова, Т.С. Константинова, Т.Ф. Шевченко. Молекулярные механизмы нейродегенерации клеток сетчатки при ишемии //«Нейродегенеративные заболевания: от генома до целостного организма» с 465-488, Наука, 2015г

ЛАБОРАТОРИЯ МОДЕЛИРОВАНИЯ СВОБОДНОРАДИКАЛЬНЫХ ФЕРМЕНТАТИВНЫХ РЕАКЦИЙ

Лаборатория моделирования свободнорадикальных ферментативных реакций

Заведующая лабораторией, д.б.н. Неделина Ольга Серафимовна

Тел.  939-74069, e-mail: olga.nedelina@gmail.com

 

Неделина Ольга Серафимовна окончила кафедру биохимии животных биологического факультета МГУ по специальности «биохимия, физиология животных». В течение многих лет работала в лаборатории радиоспектроскопии, руководимой д. ф.-м. н.  профессором Л.П.Каюшиным, основоположником развития метода ЭПР в биологии, и занималась, в частности, физико-химической проблемой трансформации энергии окисления в химическую связь АТФ. В 2007 году лаборатория радиоспектроскопии была переименована в лабораторию моделирования свободно-радикальных ферментативных реакций.

Кандидатская диссертация «Свободные радикалы при ферментативном гидролизе аденозинтрифосфата» М., Институт биофизики АН СССР, 1968 г.

Докторская диссертация «Редокс-катализ в активации синтеза АТФ в окислительном фосфорилировании" М. Институт химической физики АН СССР 1990г.

 

Основные направления исследований:

- теоретические и экспериментальные исследования элементарных химических актов важнейших физико-химических  и биохимических процессов.

- физико-химические механизмы трансформации энергии окисления в химическую связь АТФ, интермедиаты модельного фотохимического синтеза АТФ

 

Коллектив сотрудников лаборатории продолжает исследования свободно-радикальных интермедиатов синтеза АТФ, в т.ч. компьютерное моделирование сложно составных спектров ЭПР, позволяющее выполнить количественную оценку вклада различных компонент в регистрируемые в области g ≈ 2.00 суммарные сигналы. Начато новое научное направление по исследованию альтернативного протон-связанного механизма электронного транспорта с участием диполь связанных анионов. В настоящее время исследуется природа и функция спектра ЭПР атомарного водорода, обнаруженного нами среди фотоиндуцированных спектров ЭПР в моделях субионизационного диссоциативного переноса электронов. Доступные нам экспериментальные и теоретические подходы (фотохимическая генерация фотоинжектированных электронов заданной энергии, инструментальный контроль последовательных стадий их трансформации методами наносекундного лазерного фотолиза (совместно с д.х.н. П.П. Левиным), флуоресценции (совместно с д.ф.-м.н. Т.С.Журавлевой) и ЭПР, а также моделирование этого процесса методом DFT (расчёт энергий в программе Gaussian 03, приближение B3LYP и базис aug-cc-VD, совместно с д.ф.-м.н. Л.А.Чернозатонским) позволяют нам установить энергетический диапазон реакции диссоциативного присоединения электрона и характеризовать активированные продукты как интермедиаты в свободно-радикальных процессах. Выяснение природы и функции атомарного водорода очень важно для решения проблемы межмолекулярного одноэлектронного переноса, генерации свободно-радикальных интермедиатов в ферментативных реакциях, а также для исследования фотохимического переноса электрона и деструктивного взаимодействия низкоэнергетических электронов с биологическими молекулами.

 

За период с 1995 по 2015 гг. по результатам, полученным в лаборатории моделирования свободно-радикальных ферментативных реакций, опубликовано около 50 работ в рецензируемых журналах. Работы сотрудников лаборатории были поддержаны грантами Российского фонда фундаментальных исследований (РФФИ), Программами Президиума РАН и Отделения химии и наук о материалах (ОХНМ) РАН.

 

Состав лаборатории

 

Бржевская  Ольга Николаевна, к.б.н., с.н.с.

Демин Виктор Александрович, м.н.с.

Лозинова Татьяна Александровна, к.ф-м.н, с.н.с

Неделина Ольга Серафимовна, д.б.н., завлаб

 

Избранные публикации:

 

 1997

О.С.Неделина. Биосинтез АТФ. Элементарный химический акт синтеза АТФ в окислительном фосфорилировании. Монография, Москва, ИБХФ РАН, 304С

 

2005

О.Н.Бржевская, Е.Н.Дегтярев, Т.С.Журавлева, А.С.Зубков, И.В.Клименко, Э.М.Шекшеев, О.С.Неделина. Фотосенсибилизированные биологическими кофакторами атомы водорода в замороженных водных фосфатсодержащих средах. ДАН, 2005, том 405 №2 259-263

 

2007

П.П.Левин, О.Н.Бржевская, О.С.Неделина. Исследование кинетики реакций гидратированного электрона с анионами фосфата методом ядерного фотолиза. Известия РАН, сер.химическая,№7, С.1277-1280

 

2008

О.Н.Бржевская, Е.Н.Дегтярев, Т.С.Журавлева, А.С.Зубков, И.В.Клименко, Э.М.Шекшеев, О.С.Неделина. Диссоциативный захват фотоэлектронов как модель акцептирования низкоэнергетических электронов в биохимических реакциях. Доклады РАН, т. 420, №3, С. 406-411

 

2008

S. Nedelina*, O. N. Brzhevskaya, E. N. Degtyarev, A. V. Zubkov. Dissociative attachment of low-energy electrons (below ionization or electronic excitation thresholda) in frozen aqueous phosphate solutions. Oxidation Communications book 4 786-797

Лозинова Т.А., Бржевская О.Н., Дегтярев Е.Н., Рыков С.В. Анализ свободнорадикальных продуктов облучения ближним УФ при 77К замороженных растворов аденина и аденозиндифосфата, содержащих неорганический фосфат. Биофизика. 2008. Т. 53. № 2. С. 205-212.

 

2009

О.С.Неделина, О.Н.Бржевская, Е.Н.Дегтярев. Неорганические оксикислоты АОd-- Нd+ как одноэлектронный ретранслятор в механизме кислотного катализа окислительно-восстановительных реакций. Доклады РАН, т. 428, №4, с. 474–479.

 

2011

Зубков А.С., Артюхов В.И., Чернозатонский Л.А., Неделина О.С. Модель одноэлектронного транспорта. Расчёт термодинамических параметров захвата электрона связанным протоном оксикислот. Химическая физика.. Том 30. С.23-40.

 

2012

О. С. Неделина, О. Н. Бржевская, Е. Н. Дегтярев, А. С. Зубков. Кислотно-основная модель разделения зарядов и одноэлектронного переноса с участием гидроксилсодержащих молекулярных анионов. Доклады РАН Том 442, № 4, С. 501-505

 

O.S. Nedelina, O.N. Brzevskaya, and E.N. Degtyarev. Atomic Hydrogen Trapping as a Probe of Intramolecular Photoelectron Transfer Mediated by Oxyacids. Journal of Information, Intelligence and Knowledge Volume 4 Issue 4, 271-282

 

2013

Лозинова Т.А., Ландер А.В. Влияние неорганических солей на образование свободных радикалов при облучении ближним УФ замороженных водных растворов аденина и его производных. Биофизика. 2013. Т. 58. № 3. С. 445-452.

 

2014

 

Лозинова Т.А., Ландер А.В. Фотосенсибилизированное образование пероксильных радикалов в водных растворах аденина при 77К. Журнал физической химии, 2014, том 88, № 1, с. 120–127.

 

2015

Лозинова Т.А., Ландер А.В. Фотоиндуцированное образование пероксильных радикалов в водных растворах производных нуклеиновых оснований при 77К. Журнал физической химии, 2015, том 89, № 5, с. 869–878.

 

Лозинова Т.А., Лобанов А.В., Ландер А.В. Образование пероксида водорода, фотоиндуцированное ближним УФ-излучением в водных растворах производных аденина при 77К. Журнал физической химии, 2015, том 89, № 8, с. 1329–1337.

 

Публикации сотрудников лаборатории  моделирования  свободнорадикальных ферментативных  реакций за 2015 год (зав. лаб. Неделина О.С.)

- опубликованные статьи  в русских журналах: 2

  1. В.А. Демин, Л.А. Чернозатонский, «Новые металлические квази-2D структуры из слоев графена и дисульфида молибдена», Письма в ЖЭТФ, 2015, 101, 2, 107-111
  1. Т.А. Лозинова, А.В. Лобанов, А.В. Ландер. Образование пероксида водорода, фотоиндуцируемое ближним УФ-излучением в водных растворах производных аденина при 77 К. Журнал физической химии, 2015, том 89, № 8, с. 1329–1337.

                         

- статьи в иностранных журналах:

  1. V.A. Saroka, K.G. Batrakov, V.A. Demin, L.A. Chernozatonskii, «Band gaps in jagged and straight graphene nanoribbons tunable by an external electric field », J.Phys.: Condens. Matter, 2015,27, 145305 (13pp)
  1. L.A. Chernozatonskii, A.A. Artukh, V.A. Demin, E.A. Katz, «Bucky-corn:van der Waals composite of carbon nanotube coated by fullerenes», Molecular Physics 04/2015; DOI:10.1080/00268976.2015.1086834
  1. P.V. Avramov, V.A. Demin, M. Luo, C.H. Choi, P.B. Sorokin, B. Yakobson, and L.A. Chernozatonskii, "Translation Symmetry Breakdown in Low-Dimensional Lattices of Pentagonal Rings", J.Phys.Chem.Lett, 2015,6, pp.4525-4531

ЛАБОРАТОРИЯ РЕГУЛЯЦИИ БИОЭНЕРГЕТИЧЕСКИХ И ИММУННЫХ ПРОЦЕССОВ

Лаборатория регуляции биоэнергетических и иммунных процессов

Заведующий - доктор физ.-мат. наук, профессор  Тихонов Александр Николаевич

Телефон: (495) 939-74-42

 

А.Н.Тихонов - выпускник кафедры биофизики физического факультета МГУ имени М.В.Ломоносова (1972), в 1974 г. защитил кандидатскую диссертацию (научный руководитель - докт. хим. наук, профессор Л.А.Блюменфельд), в 1987 г. защитил докторскую диссертацию. С 1975 г. – сотрудник кафедры биофизики физического факультета МГУ. В ИБХФ РАН работает с 2004 г. Лауреат Ломоносовской премии МГУ за научную работу (2001 г., совместно с Л.А.Блюменфельдом и В.А.Твердисловым). Области научных интересов – биофизика и биохимическая физика, биоэнергетика, магнитная радиоспектроскопия.

 

Основные направления исследований лаборатории

 

  • Физико-химические механизмы трансформации энергии в хлоропластах – энергопреобразующих органеллах растительной клетки:

- механизмы энергетического сопряжения электронного и протонного транспорта с процессами синтеза АТФ в хлоропластах;

- светозависимая регуляции электронного транспорта в хлоропластах;

- механизмы защиты фотосинтетического аппарата растений от светового стресса;

- математическое моделирование электронного и протонного транспорта в хлоропластах.

  • Регуляция иммунных процессов:

- изучение особенности образования и роли оксида азота в организме, тканях животных и клетках иммунной системы в условиях гипоксии.

- изучение роли доноров оксида азота в усилении действия химиотерапевтических противоопухолевых препаратов (циклофосфан и др.) и молекулярных механизмов действия этих соединений в комбинациях с гидроксамовыми кислотами и антиоксидантами.

 

Лаборатория регуляции биоэнергетических и иммунных процессов была организована выдающимся отечественным биофизиком, проф. Л.А.Блюменфельдом. Лаборатория вошла в состав Института биохимической физики с момента его образования в 1996 г. Научные направления лаборатории сформировались ранее, в лаборатории физической химии биополимеров Института химической физики РАН, созданной Л.А.Блюменфельдом по инициативе акад. Н.Н.Семенова. За время, прошедшее с момента образования лаборатории, основные направления исследований остались прежними (исследование механизмов трансформации энергии в биоэнергетических системах клетки, А.Н.Тихонов, О.П.Самойлова, В.В.Птушенко), однако появились новые направления, связанные с изучением механизмов регуляции иммунных процессов (З.В.Куроптева, Л.М.Байдер). Организатор лаборатории - Л.А.Блюменфельд – один из пионеров применения метода электронного парамагнитного резонанса (ЭПР) для изучения биологических систем. Спектроскопия ЭПР лежит в основе большинства экспериментальных исследований, проводимых в лаборатории регуляции биоэнергетических и иммунных процессов. Метод ЭПР позволяет следить за процессами электронного транспорта и окислительно-восстановительными реакциями в биохимических системах. Наряду с экспериментальными исследованиями в области биохимической физики биоэнергетических и иммунных процессов, в лаборатории ведутся теоретические исследования механизмов регуляции биоэнергетических процессов.

 

Состав лаборатории

 

Куроптева Зоя Вениаминовна, докт. биол. наук, в.н.с.

Байдер Лариса Михайловна, канд. хим. наук, ст.н.с;

Самойлова Ольга Петровна, канд. биол. наук, н.с.

Птушенко В.В., канд. физ.-мат. наук, н.с.

Избранные публикации сотрудников лаборатории

 

  1. Blumenfeld L.A., Tikhonov A.N. (1994) Biophysical Thermodynamics of Intracellular Processes. Molecular Machines of the Living Cell. Springer-Verlag, New-York, 178 pages with 54 illustrations.
  2. Trubitsin B.V., Tikhonov A.N. «Determination of a transmembrane pH difference in chloroplasts with a spin label Tempamine». Journal of Magnetic Resonance, v.163, pp.257-269 (2003).  
  3. Ikryannikova L.N., Ustynyuk L.Yu., Tikhonov A.N. «DFT Study of nitroxide radicals. Effects of solvent on structural and electronic characteristics of 4-amino-2,2,5,5-tetramethyl-3-imidazoline-N-oxyl».  J. Physical Chemistry A, v.108, pp.4759-4768 (2004).
  4. Trubitsin B.V., Ptushenko V.V., Koksharova O.A., Mamedov M.D., Vitukhnovskaya L.A., Grigor’ev I.A., Semenov A.Yu., Tikhonov A.N.  «EPR study of electron transport in the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803. Oxygen-dependent interrelations between photosynthetic and respiratory electron transport chains». – Biophys. Acta, v. 1708, pp. 238-249 (2005).
  5. Dementiev A.A., Baikov A.A., Ptushenko V.V., Khomutov G.B., Tikhonov A.N. «Biological and polymeric self-assembled hybrid systems: structure and properties of thylakoid /polyelectrolyte complexes». Biochim. Acta, v. 1712, pp. 9-16 (2005).
  6. Ptushenko V.V., Ikryannikova L.N., Grigor’ev I.A., Kirilyuk I.A., Trubitsin B.V., Tikhonov A.N. «Interaction of imidazoline and imidazolidin-based derivatives of nitroxide radicals with chloroplasts». Applied Magnetic Resonance, v.30, рр. 329-343 (2006).
  7. Tikhonov A.N., Agafonov R.V., Grigor’ev I.A., Kirilyuk I.A.,  Ptushenko V.V., Trubitsin B.V. «Spin-probes designed for measuring the intrathylakoid pH in chloroplasts». Biophis. Acta, v.1777, pp.285-294 (2008). DOI:10.1016/j.bbabio.2007.12.002
  8. Байдер Л.М.,Реутов В.П.Крушинский А.Л.Кузенков В.С.Сорокина Е.Г.Кошелев В.Б.Фадюкова О.Е.Жумабаева Т.Т.Комисарова Л.Х.Пинелис В.Г.,Косицын Н.С.Куроптева З.В. «Исследование методом ЭПР влияния гипоксии на образование оксида азота (NO) в крови крыс линии Крушинского-Молодкиной». Биофизика, Т. 54, № 5, с. 894-899 (2009).
  9. Ikriannikova L.N., Ustynyuk L.Yu., Tikhonov A.N. «DFT study of nitroxide radicals: explicit modeling of solvent effects on the structural and electronic characteristics of 4-amino-2,2,6,6-tetramethyl-piperidine-N-oxyl». Magnetic Resonance in Chemistry, 48, pp. 337–349 (2010). DOI:10.1002/mrc.2585
  10. Романовский Ю.М., Тихонов А.Н. « Молекулярные преобразователи энергии живой клетки. Протонная АТР-синтаза – вращающийся молекулярный мотор». Успехи физических наук, Т.180, №9, С. 931-956 (2010).
  11. Куроптева З.В.,Реутов В.П.Байдер Л.М.Белая О.Л.Крушинский А.Л.Кузенков В.С.Молдалиев Ж.Т. «Влияние гипоксии на образование оксида азота в тканях сердца животных».  Докл. РАН, Т. 441, № 3, с. 406-409 (2011).
  12. Kuvykin I.V., Ptushenko V.V., Vershubskii A.V., Tikhonov A.N. «Regulation of electron transport in C3 plant chloroplasts in situ and in silico. Short-term effects of atmospheric СО2 and О2». Biochim. Acta, 1807, 336-347 (2011). DOI:10.1016/j.bbabio.2010.12.01
  13. Samoilova O.P., Ptushenko V.V., Kuvykin I.V., Kiselev S.A., Ptushenko O.S., Tikhonov A.N. «Effects of light environment on the induction of chlorophyll fluorescence in leaves: A comparative study of Tradescantia species of different ecotypes». BioSystems, 105, 41–48 (2011). DOI:1016/j.biosystems.2011.03.003   
  14. Ptushenko V.V., Ptushenko E.A., Samoilova O.P., Tikhonov A.N. «Chlorophyll fluorescence in the leaves of Tradescantia species of different ecological groups: Induction events at different intensities of actinic light». BioSystems, 112, 85-97 (2013). DOI:10.1016/j.biosystems.2013.08.001
  15. Богатыренко Т.Н., Коновалова Н.П., Сипягин А.М., Богатыренко В.Р., Куроптева З.В., Байдер Л.М., Сашенкова Т.Е., Фёдоров Б.С. «Полифункциональное действие биологически активных соединений в усилении противоопухолевой химиотерапии циклофосфана». Известия РАН. Серия химическая. № 5. С.1187-1191 (2014).
  16. Tikhonov A. «pH-Dependent regulation of electron transport and ATP synthesis in chloroplasts». Photosynthesis Research, 116, 511-534 (2013). DOI: 10.1007/s11120-013-9845-y
  17. Tikhonov A.N., Vershubskii A.V. « Computer modeling of electron and proton transport in chloroplasts». BioSystems, 121, 1-21 (2014). http://dx.doi.org/10.1016/j.biosystems.2014.04.007
  18. Tikhonov A. «The cytochrome b6f complex at the crossroad of photosynthetic electron transport pathways». Plant Physiology and Biochemistry, 81, 163-183 (2014). DOI:10.1016/j.plaphy.2013.12.011
  19. Tikhonov A.N. «Induction events and short-term regulation of electron transport in chloroplasts: An overview». Photosynthesis Research, 125, 65-94 (2015). DOI:10.1007/s11120-015-0094-0

 

2015 год:

- опубликованные статьи в отечественных журналах – 5 статей

 

  1. Богатыренко Т.Н., Куроптева З.В., Байдер Л.М., Сашенкова Т.Е., Мищенко Д.В., Богатыренко В.Р., Коновалова Н.П. «Влияние аскорбиновой кислоты на химиотерапевтическое действие цитостатиков и их комбинаций с нитратом натрия и гидроксамовыми кислотами». Известия РАН. Серия химическая. № 10. С.48-55 (2015).

  2. Куроптева З.В., Реутов В.П., Байдер Л.М., Крушинский А.Л. «Комплексы оксида азота с гемоглобином и парамагнитные металлоферменты в мозге и крови млекопитающих после кратковременной гипоксии».  Журнал неврологии и психиатрии им. С.С. Корсакова. Т.115. №10. С.57-62 (2015).

  3. Птушенко В.В., Марцевич С.Ю. «Пыль: сердечный отклик». Наука и жизнь, № 1, с. 36-38 (2015).

  4. Птушенко В.В. «Ледяная физика». Наука и жизнь, № 3, с. 38-41 (2015).

  5. Птушенко В.В. «Метан из растений». Наука и жизнь, № 6, с. 56-58 (2015).

 

 

- опубликованные статьи в иностранных журналах – 8 статей

 

  1. Tikhonov A.N. Induction events and short-term regulation of electron transport in chloroplasts: An overview. Photosynthesis Research, v.125, pp.65-94 (2015). DOI10.1007/s1112001500940

  2. Trubitsin B.V., Vershubskii A.V., Priklonskii V.I., Tikhonov A.N. Short-term regulation and alternative pathways of photosynthetic electron transport in Hibiscus rosa-sinensis Journal of Photochemistry and Photobiology B: Biology, v.152, pp.400-415 (2015). DOI:10.1016/j.jphotobiol.2015.07.015

  3. Kuropteva Z.V., Belaya O.L., Baider L.M., Bogatyrenko T.N. The Effect of Antioxidant Drug Mexidol on Bioenergetic Processes and Nitric Oxide Formation in the Animal Tissues.  Oxidation Communications, v. 38(1), pp.85-93 (2015). 

  4. Dyakov M., Insarova I., Kharabadze D., Ptushenko V., Shtaer O. “Influence of extreme ambient temperatures and anaerobic conditions on Peltigera aphthosa (L.) Willd. viability”. Life Sciences in Space Research, v.7, pp.66-72. (2015).

  1. Ptushenko V.V., Avercheva O.V., Bassarskaya E.M., Berkovich Yu.A., Erokhin A.N., Smolyanina S.O., Zhigalova T.V. “Possible reasons of a decline in growth of Chinese cabbage under a combined narrowband red and blue light in comparison with illumination by high-pressure sodium lamp”. Scientia Horticulturae, v.194, pp.267-277 (2015). http://dx.doi.org/10.1016/j.scienta.2015.08.021.

  2. Ptushenko V.V., Cherepanov D.A., Krishtalik L. “Electrostatics of the Photosynthetic Bacterial Reaction Center. Protonation of Glu L 212 and Asp L 213 – a new method of calculation”. Biochimica et Biophysica Acta (BBA- Bioenergetics), v.1847, pp.1495-508 (2015). http://dx.doi.org/10.1016/j.bbabio.2015.07.010.

  3. Fesenko I.A., Arapidi G.P., Skripnikov A.Yu, Alexeev D.G., Kostryukova E.S., Manolov A.I., Altukhov I.A., Khazigaleeva R.A., Seredina A.V., Kovalchuk S.I., Ziganshin R.H., Zgoda V.G., Novikova S.E., Semashko T.A., Slizhikova D.K., Ptushenko V.V., Gorbachev A., Govorun V.M., Ivanov V.T. «Specific pools of endogenous peptides are present in gametophore, protonema, and protoplast cells of the moss Physcomitrella patens». BMC plant biology15(1), p. 87 (2015).

  4. Ptushenko, V., & Chertkova, R. V. (2015). The experimental determination of redox-potential of mutated cytochrome c with eight charge changing substitutions. bioRxiv, 015131. (препринт).

 

- опубликованные и поданные в печать монографии, учебники: - 1 учебник

 

Потапова Т.В., Баль Л.В., Бойцова Л.Ю., Петрова Ю.В., Птушенко В.В. Методическое пособие «Организация и проведение конкурсов исследовательских проектов с участием детей до 10-12 лет в области естествознания». Департамент образования города Москвы. 100 с. (Подано в печать)

 

- опубликованные статьи в монографиях, сборниках трудов:

 

  1. Вершубский А.В., Мишанин В.И., Приклонский В.И., Тихонов А.Н. (2015) Математическое моделирование электронного транспорта, сопряженного с синтезом АТФ в хлоропластах с учетом латеральной гетерогенности тилакоидов. Материалы XI Международного симпозиума «Новые и нетрадиционные растения и их использование». Пущино, стр. 200-203. Изд-во РУДН, Москва.

  2. Мишанин В.И., Беньков М.А., Минин А.А., Пацаева С.В., Птушенко В.В., Соловченко А.Е., Тихонов А.Н. (2015) Сравнительное исследование биофизических и биохимических показателей фотосинтетического аппарата листьев двух видов традесканции (T. fluminensis и T. sillamontana). Материалы XI Международного симпозиума «Новые и нетрадиционные растения и их использование». Пущино, стр. 254-258. Изд-во РУДН, Москва.

ЛАБОРАТОРИЯ НЕЙРОЛИПИДОЛОГИИ

Лаборатория нейролипидологии

Заведующая лабораторией - Алесенко Алиса Владимировна, доктор биологических наук, профессор, заслуженный деятель науки РФ

email: ales@sky.chph.ras.ru,

тел.: 8495 939 71 59

 

Алесенко Алиса Владимировна закончила Московский Государственный Университет им. М.В. Ломоносова по специальности химия. С 1965 г работает в ИХФ РАН, а с 1996 г. - в ИБХФ РАН. Кандидатскую диссертацию защитила в 1972 г. докторскую диссертацию - в 1988 г. В 1992 г. присвоено звание профессора по специальности биохимия, а в 2008 г. - звание «Заслуженный деятель науки РФ». Являлась приглашенным ученым и приглашенным профессором Университета Дюка и Джонса Хопкинса (США), (1992-1993 гг.), Университета Joseph Fourier (Франция), (2000-2001 гг). Алесенко А.В. - эксперт Российских и международных научных фондов (РФФИ, National Science Foundation (USA), Фонда Министерства науки и образования РФ),  рецензент статей в отечественных и зарубежных изданиях (Ж. Биохимия, Ж. Масс-спекторометрия, Intern. J. of Molecular Sci.,  Biochemistry др.). Международный Биографический Центр (Кембридж, Великобритания) включал А.В. Алесенко в список ста лучших ученых в 2010 г. и в 2015 г. а в 2012 г. отметил ее научные достижения сертификатом Университета Кембриджа. Область научных интересов: биохимия липидов, липиды клеточного ядра,  нейродегенеративные патологии, нейролипидология.

 

Основные  направления исследований:

- Определение роли липидов в патогенезе нейродегенеративных заболеваний.

- Изучение роли сфинголипидов в развитии болезни Альцгеймера (БА) на инъекционной  и генетической моделях  у животных  и  спорадической форме у человека.

- Поиск маркеров липидной природы, позволяющих диагностировать раннюю стадию БА и  использовать их для мониторинга эффективности лечения этого заболевания.

 

В последнее десятилетие значительно возрос интерес к изучению роли липидов в патогенезе БА. Особое внимание привлекают сфинголипиды, т.к. ряд из них участвует в процессинге и олигомеризации b-амилоидного пептида и в нарушении синаптической функции при БА. Изучение сфинголипидов в лаборатории проводится методами высокоэффективной тонкослойной хроматографии и  хромато-масс-спектрометрии. В качестве объектов исследования используются структуры мозга (кора, мозжечок и гиппокамп) животных (мышей и крыс) и плазма пациентов с БА.

         Исследуется влияние препаратов, обладающих нейропротекторными свойствами, на изменение метаболизма сфинголипидов в структурах мозга мышей и в плазме пациентов с БА. В качестве маркеров изучаются уровень церамида и экспрессия генов, кодирующих синтез ферментов, которые участвуют в метаболизме церамида, на модели БА в структурах мозга животных, в плазме крови пациентов с разными стадиями заболевания и в процессе их лечения нейропротекторами, у которых мишенями служат липиды клеток мозга.

Методом rtПЦР проводятся тестовые эксперименты по анализу активности генов, кодирующих сфингомиелиназы, церамидазы и сфингомиелинсинтазы, которые генерируют церамид в результате ферментативного гидролиза сфингомиелина (сфингомиелиназы), участвуют в генерации сфингозина из церамида (церамидазы) и синтезируют сфингомиелин из церамида (сфингомиелинсинтазы) в образцах структур мозга мышей и в плазме крови пациентов с БА. Работы с клиническим материалом проводятся совместно с Научным Центром Психического Здоровья.

 

Состав лаборатории:

Алесенко Алиса Владимировна, дбн, зав. лаб.

Гурьянова Светлана Владимировна кбн, нс

Гутнер Ульяна Александровна, кбн, нс

Шупик Мария Александровна кбн, нс

Лебедева Алена Олеговна мнс

 

Список избранных публикаций:

 

  1. A.V. Alessenko, W.A. Khan, W.C. Wetsel, Y.A. Hannun, “Selective changes in protein kinase C isoenzymes in rat liver nuclei during liver regeneration”, Biochem. Biophys. Res. Commun., vol. 182, no. 3, pp. 1333-1339, 1992.
  2. V. Alessenko, and A.V. Khrenov “The Role of sphingosine and induced apoptosis”. Lipids, vol.34 (suppl.),  pp.75-76, 1999.
  3. A.V. Alessenko and E.B. Burlakova, “Functional role of phospholipids in the nuclear events”, Bioelectrochemistry, vol. 58, no. 1, pp.13-21, 2002.
  4.  Alessenko A.V., Bugrova A.E.,  Dudnik L.B.  Connection of  lipid peroxide oxidation with sphingomyelin cycle pathway in the development of Alzheimer's disease // Biochem. Soc. Transaction. 2004. Vol. 32. P. 144–146).
  5. Alessenko, A.V., Shupik, M.A., Bugrova, A.E., Dudnik, L.B., Shingarova, L.N., Mikoyan, V.D., and Vanin, A.F. The relation between sphingomyelinase activity, lipid peroxide oxidation and NO-releasing in mice liver and brain. 2005 FEBS Lett., 579, 5571–5576.
  6. Алесенко А.В., Каратассо Ю.О., Коротаева А.А., Шупик М.А. “Роль сфинголипидов в патогенезе болезни Альцгеймера” Психиатрия 2008 ; №4-6, с.50-59.
  7. ( Alessenko A.V. (2006) in “New research on Alzheimer’s disease”. ( Welsh, E.M., ed.), pp. 168–189).
  8. А.В. Алесенко Т.А. Гарибова, Т.А. Воронина, С.А. Литвинова, А.Л. Кузнецова, А.Е. Кульчиков, “Особенности действия мемантина на моделях холинергического дефицита и интрацеребральной посттравматической гематомы (геморрагического инсульта) в опытах на крысах “ Экспериментальная и клиническая фармакология, 2008, т.71, №2, с. 8-13.
  9. Alessenko A.V., Karatasso Yu.O., Korotayeva A.A., Shevtsova E.F., Shingarova L.N., Bachurin S.O. “Effects Of Dimebon On The TNF-Alpha- Induced Disorders Of Sphingolipids In Mice Brain Sections“ Naunyn-Schmied Arch Pharmacol. (2009) 380:360–362
  10. Каратассо Ю.О., Суллард К., Федорова Я.Б., Гаврилова С.И., Алесенко А.В. «Исследование методом жидкостной хроматографии/масс-спектрометрии фосфолипидного спектра плазмы крови пациентов с болезнью Альцгеймера при лечении ривастигмином (экселоном) и мемантином» // Масс-спектрометрия. 2008. Т. 5, № 3. С. 106–116., 
  11. Алесенко А.В., Круговов Д.А., ШингароваЛ.Н., Бугайчук О.В., Шупик М.А., Гурьянова С.В., Гаврилова С.И., Калын Я.Б., Селезнева Н.Д., Колыхалов И.В., Федорова Я.Б. “Мониторинг эффективности лечения болезни Альцгеймера на основе тестирования липидного спектра методом масс-спектрометрии”. В сборнике «Нейродегенеративные заболевания: современные представления о патогенезе, диагностике и лечении». Стр. 8-11, 2010. Москва
  12. AV Alessenko “The Potential Role for Sphingolipids in Neuropathogenesis of Alzheimer’s Disease” Biochemistry (Moscow) Supplement     Series B: Biomedical Chemistry,  2013, Vol. 7, No. 2, pp. 108–123.
  1. 13. Алесенко А.В.. Гаврилова С.И., Федорова Я.Б., Тиганов А.С. «Церамиды –потенциальные маркеры болезни Альцгеймера» Ж. Психиатрия, 2014, № 1, стр. 13-25.
  2. A. V. Alessenko, S. O. Bachurin, S. V. Gurianova, Y. O. Karatassoa, E. F. Shevtsova, and L. N. Shingarova”Tumor Necrosis Factor_Alpha Is a Potential Target for the Neuroprotector Dimebon” Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 2015, Vol. 9, No. 2, pp. 188–197.
  3. Alessenko AV, Gurianova SV “Potential role of ceramides in neurodegenerative diseases” in book : “Sphingomyelin . Ceramides: Occurrence, Biosynthesis and role in Disease. 2015, P 21-53. NOVA Publishers Hauppauge, NY, USA, ed. S.Watkins.

Публикации сотрудников лаборатории нейролипидологии за 2015 год (зав. лаб. А.В. Алесенко)

- опубликованные статьи

V. Alessenko, S. O. Bachurin, S. V. Guyanova, Y. O. Karatasso, E. F. Shevtsova, and L. N. Shingarova «Tumor Necrosis Factor_Alpha Is a Potential Target for the Neuroprotector Dimebon» ISSN 1990_7508, Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry, 2015, Vol. 9, No. 2, pp. 188–197.

 

Гурьянова С.В. Сравнительная оценка мурамил пептидов – лигандов рецепторов врожденного иммунитета в регуляции экспрессии оксида азота. Российский иммунологический журнал (РИЖ)  №4-2015, стр. 29-32.

 

И.Г. Козлов, С.В. Гурьянова, Н.В. Колесникова, Т.М. Андронова.  Мурамилпептиды и другие агонисты рецепторов врождённого иммунитета в комплексной терапии аллергических заболеваний. Российский аллергологический журнал (РАЖ)  №5-2015, стр. 59-67.

 

Kashirina E., Reshetov P., Alekseeva L., Khlagatyan  S., Ryazantsev D.,  Zubov V., Guryanova S., Svirshchevskaya E. Capsulation of House-Dust-Mite Allergens into Nanoparticles Developed from Chitosan and Alginate. Nanotechnologies in Russia, 2015, N10 (7-8), 627-635.

 

Vadim D. Nikitushkin,  Galina R. Demina,  Margarita O. Shleeva , Svetlana V. Guryanova ,  Alessia Ruggiero ,  Rita Berisio,  Arseny S. Kaprelyants.  A product of RpfB and RipA joint enzymatic action promotes the resuscitation of dormant mycobacteria. FEBS JOURNAL 282(13),  APRIL 2015.

 

Boue S., Fields B.,  Hoeng J., Guryanova S.  et al. Enhancement of COPD biological networks using a web-based collaboration interface. F1000 RESEARCH 4, JANUARY 2015. 

Коллективные монографии:

A.V. Alessenko, S.V. Gurianova “Sphingomyelin and Ceramides: Occurance, Biosynthesis and Role in Diseases” NOVA Sci. Publisher NY, USA, Ed. C. Watkins, 2015, pp. 21-53. (85 стр.)

 

- опубликованные статьи в монографиях, сборниках трудов:

Alessenko, S.V. Gurianova, “Potential role of ceramides in neurodegenerative diseas. in book: “Sphingomyelin and Ceramides: Occurance, Biosynthesis and Role in Disese” NOVA Sci. Publisher NY, USA, Ed. C. Watkins, 2015, pp. 21-53.

ЛАБОРАТОРИЯ МАСС-СПЕКТРОМЕТРИИ БИОМАКРОМОЛЕКУЛ

Лаборатория масс-спектрометрии биомакромолекул
Заведующий - д.ф.-м.н. Николаев Евгений Николаевич
Телефон: 939-73-70; 137-10-07
Лаборатория масс-спектрометрии биомакромолекул
 

Лаборатория масс-спектрометрии биомакромелекул

 

Заведующий: д.ф.-м.н., профессор Николаев Евгений Николаевич

Телефон: 939-73-70, Email: ennikolaev@rambler.ru

 

Евгений Николаевич Николаев – выпускник МФТИ (1971г.), кандидат физико-математических наук (МФТИ 1974): «Масс-спектрометрическое исследование формирования ионных кластеров при бомбардировке ионами замороженных полярных веществ»; Доктор физико-математических наук (Институт энергетических проблем химической физики АН СССР,1992): «Масс-спектрометрия ионного циклотронного резонанса и ее применение при точном измерении массы и в кинетической масс спектрометрии»; Профессор по специальности Химическая физика 1994 год.

Руководит лабораторией масс-спектрометрии биомакромолекул с 2003 года, а также лабораторией ионной и молекулярной физики в Институте Энергетических Проблем Химической Физики им. В.Л. Тальрозе РАН, группой масс-спектрометрии отдела протеомных исследований и масс-спектрометрии НИИ Биомедицинской Химии им. В.Н. Ореховича и является научным руководителем лаборатории ионной и молекулярной физики МФТИ.

В 2004 году на базе лаборатории масс-спектрометрии биомакромолекул ИБХФ им. Н.М. Эмануэля РАН и ИХФ им. Н.Н. Семенова РАН создан Центр масс-спектрометрии Российской академии наук под руководством проф. Е.Н. Николаева.

Е.Н. Николаев является профессором на кафедре Молекулярной медицины МФТИ, а также профессором Центра космических исследований Сколтеха. Руководитель 22 кандидатских диссертаций. Организатор 4-х Всеросийских школ по масс-спектрометрии. Организатор European Conference on FT ICR mass spectrometry Moscow 2008, International Workshop on Imaging Mass Spectrometry, Moscow, 2012 and International Conference on Innovations in Mass Spectrometry Instrumentation, St Petersburg 2013

Основные направления исследований:

  • Развитие техники масс-спектрометрии ИЦР ультравысокого разрешения
  • Развитие новых методов исследования биомакромолекул, входящих в состав физиологических жидкостей человека при помощи прямой масс-спектрометрии
  • Развитие методов высокоэффективной идентификации модификаций белков для анализа взаимосвязей с патологическими процессами
  • Развитие методов протеотипирования белков на основе подхода Top-Down
  • Разработка хромато-масс-спектрометрических методов быстрого анализа протеома, метаболома, липидома биологических жидкостей и тканей
  • Классификационный анализ природных резервуаров органического углерода методами сверхточной масс-спектрометрии

Медико-биологические исследования проводятся совместно с ведущими НИИ и медицинскими учреждениями г. Москвы (ФГБУ НЦАГиП им. В.И. Кулакова Минздрава России, ИМБП РАН, ИМБ РАН, НИИ нейрохирургии им. Н.Н.Бурденко). Работа по классификационному анализу природных резервуаров органического углерода методами сверхточной масс-спектрометрии ведется совместно группой проф., д.х.н. Перминовой Ирины Васильевны, Хим. факультет МГУ.

Состав лаборатории:

Николаев Евгений Николаевич, зав. лаб., д.ф-м.н., профессор

Попов Игорь Алексеевич, с.н.с., к.ф.-м.н.

Кононихин Алексей Сергеевич, в.н.с., к.ф.-м.н.

Костюкевич Юрий Иродионович, н.с., к.ф.-м.н.

Индейкина Мария Игоревна, н.с.

Кукаев Евгений Николаевич, м.н.с.

Пеков Станислав Игоревич, м.н.с.

Спасский Александр Ильич, инженер

Избранные публикации:

  1. Eugene N. Nikolaev, Yury I. Kostyukevich, Gleb N. Vladimirov, Fourier transform ion cyclotron resonance (FT ICR). Theory and simulations, Mass spectrometry review. published online: 10 FEB 2014, DOI: 10.1002/mas.21422 (Impact Factor: 7.735, 2013)
  2. Denis G. Ilyushina, Ivan V. Smirnov, Alexey A. Belogurov, Jr.,Igor A. Dyachenko, Tatiana Iu. Zharmukhamedov , Tatjana I. Novozhilova, Eugene A. Bychikhine, Marina V. Serebryakov, Oleg N. Kharybin, Arkadii N. Murashev, Konstantin A. Anikienko, Eugene N. Nikolaev, Natalia A. Ponomarenko, Dmitry D. Genkin, G. Michael Blackburn, Patrick Masson, Alexander G. Gabibov Chemical polysialylation of human recombinant butyrylcholinesterase delivers a long-acting bioscavenger for nerve agents in vivo, PNAS 2013 Jan 22;110(4):1243-1248 (Impact factor 9.737, 2012)
  1. Popov I.A., Nagornov K., Vladimirov G.N., Kostyukevich Y.I., Nikolaev E.N., Twelve million resolving power on 4.7 T Fourier transform ion cyclotron resonance instrument with dynamically harmonized cell-observation of fine structure in peptide mass spectra, Journal of The American Society for Mass Spectrometry, 2014, vol:25(5), pages:790-799(Impact Factor 3.592)
  2. Kostyukevich Y., Kononikhin A., Nikolaev E., Popov I., In-ESI source hydrogen/deuterium exchange of carbohydrate ions, Analytical Chemistry, 2014, vol:86(5), pages:2595-2600(Impact factor 5.695)
  1. Indeykina, Maria; Popov, Igor; Kozin, Sergey; Kononikhin, Alexey; Kharibin, Oleg; Tsvetkov, Philippe; Makarov, Alexander; Nikolaev, Eugenij, Capabilities of MS for analytical quantitative determination of the ratio of α- and β-Asp7 isoforms of the amyloid-β peptide in binary mixtures, Anal. Chem., 2011, 83 (8), 3205–3210 •(Impact factor 5.695, 2012)
  2. Eugene N. Nikolaev, Ivan A. Boldin, Roland Jertz and Gökhan Baykut. Initial Experimental Characterization of a new ultra-high resolution FT-ICR Cell with Dynamic Harmonization, Journal of the American Society for Mass Spectrometry, 22(7) 2011, 1125-1129 (Impact Factor 3.592, 2012)
  3. Eugene N. Nikolaev, Roland Jertz, Anton Grigoryev, and Gökhan Baykut, Fine Structure in Isotopic Peak Distributions Measured Using a Dynamically Harmonized Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance Cell at 7 T Anal. Chem., 2012, 84 (5), pp 2275–2283 •(Impact factor 5.695, 2012)
  1. Feldman T.B., Yakovleva M.A., Arbukhanova P.M., Borzenok S.A., Kononikhin A.S., Popov I.A., Nikolaev E.N., Ostrovsky M.A., Changes in spectral properties and composition of lipofuscin fluorophores from human-retinal-pigment epithelium with age and pathology, Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2015, vol:407(4), pages:1075-1088
  2. И.А. Попов, А.С. Кононихин, Е.Н. Кукаев, Н.Л. Стародубцева, М.И. Индейкина, Ю.И. Костюкевич, Г.Н. Владимиров, М.И. Николаева, С.И. Пеков, Е.Н. Николаев. Анализ молекул биологического происхождения методами масс-спектрометрии высокого разрешения (пептиды и белки), в книге «Физическая химия биопроцессов»,  под редакцией С.Д.Варфоломеева 2014.
  3. Popov I.A., Indeikina M.I., Pekov S.I., Starodubtseva N.L., Kononikhin A.S., Nikolaeva M.I., Kukaev E.N., Kostyukevich Y.I., Kozin S.A., Makarov A.A., Nikolaev E.N., Estimation of phosphorylation level of amyloid-beta isolated from human blood plasma: Ultrahigh-resolution mass spectrometry, Molecular Biology, 2014, vol:48(4), pages:607-614
  4. A. Popov, M. I. Indeikina, A. S. Kononikhin, N. L. Starodubtseva, S. A. Kozin, A. A. Makarov, E. N. Nikolaev, ESI-MS Identification of the Minimal Zinc-Binding Center in Natural Isoforms of beta-Amyloid Domain 1-16, Molecular Biology, 2013, vol:47(3), pages:440-445
  1. Yury I Kostyukevich, Gleb N Vladimirov, Eugene N Nikolaev Dynamically Harmonized FT-ICR Cell with Specially Shaped Electrodes for Compensation of Inhomogeneity of the Magnetic Field. Computer Simulations of the Electric Field and Ion Motion Dynamics. Journal of the American Society for Mass Spectrometry 09/2012 ;23(12):2198-207; (Impact Factor 3.592, 2012)•
  2. Eugene N Nikolaev, Roland Jertz, Anton Grigoryev, Gökhan Baykut Fine structure in isotopic peak distributions measured using a dynamically harmonized Fourier transform ion cyclotron resonance cell at 7 T. Anal. Chem. 03/2012; 84(5):2275-83. •(Impact factor 5.695, 2012)
  3. Gleb Vladimirov, Christopher L Hendrickson, Greg T Blakney, Alan G Marshall, Ron M A Heeren, Eugene N Nikolaev Fourier transform ion cyclotron resonance mass resolution and dynamic range limits calculated by computer modeling of ion cloud motion. Journal of the American Society for Mass Spectrometry 02/2012; 23(2):375-84 (Impact Factor 3.592, 2012)
  4. Kostyukevich Y, Kononikhin A, Popov I, Nikolaev E. Simple atmospheric hydrogen/deuterium exchange method for enumeration of labile hydrogens by electrospray ionization mass spectrometry. Anal Chem. 85(11), (2013) 5330-5334(Impact factor 5.695, 2012)
  5. Kostyukevich Y, Kononikhin AS, Popov IA, Kharybin ON, Perminova I, Konstantinov AI, Nikolaev EN. Enumeration of labile hydrogens in natural organic matter using hydrogen/deuterium exchange Fourier Transform Ion Cyclotron Resonance mass spectrometry. Anal Chem. 85 (22), (2013)11007-11013 •(Impact factor 5.695, 2012)

Публикации сотрудников лаборатории масс-спектрометрии биомакромолекул за 2015 год (зав. лаб. Е.Н. Николаев)

 

- опубликованные статьи в отечественных журналах : 6 статей

 

Костюкевич Ю.И, Кононихин А.С., Попов И.А., Кукаев Е.Н., Пеков С.И., Индейкина, Курьяков В.С, Чеканцева Л., Николаев Е.Н. Использование метода дейтеро/водородного обмена в сочетании с масс-спектрометрией сверхвысокого разрешения для структурного исследования гетероатомных соединений нефти – Известия Российской академии наук. Энергетика. 2015. № 6.

 

Стародубцева Н.Л., Бугрова А.Е., Кононихин А.С., Вавина О.В., Широкова В.А., Наумов В.А., Гаранина И.А., Лагутин В.В., Попов И.А., Логинова Н.С., Ходжаева З.С., Франкевич В.Е., Николаев Е.Н., Сухих Г.Т. Возможность прогнозирования и ранней диагностики преэклампсии по пептидному профилю мочи. Акушерство и гинекология. 2015. № 6. С. 46-52.

 

Пастушкова Л.Х., Кононихин А.С., Тийс Е.С., Образцова О.А., Доброхотов И.В., Иванисенко В.А., Николаев Е.Н., Ларина И.М. выявление значимо представленных биологических процессов по составу протеома мочи космонавтов на первые сутки после длительных космических полетов. Российский физиологический журнал им. И.М. Сеченова. 2015. Т. 101. № 2. С. 222-237.

 

Ryabenko, A. G., Kiryukhin, D. P., Kichigina, G. A., Zhigalina, O. M., Nikolaev, E. N., & Krasnovskii, A. N. (2015). Reactions on single-walled nanotubes: 1. Radiation-stimulated reactions in aqueous suspensions of single-walled carbon nanotubes in surfactant solutions. High Energy Chemistry (Химия высоких энергий), 49(1), 48-52.

 

Ryabenko, A. G., Kiryukhin, D. P., Kichigina, G. A., Zhigalina, O. M., Sul’yanov, S. N., Nikolaev, E. N., M. N. Larichev, S. S. Bukalov, Krasnovskii, A. N. (2015). Reactions on single-walled nanotubes: 2. Reactions on the nanosized surface of nanotubes in liquid hydrocyanic acid. High Energy Chemistry(Химия высоких энергий, 49(1), 53-57.

 

Kononikhin AS, Fedorchenko KY, Ryabokon AM, Starodubtseva NL, Popov IA, Zavialova MG, Anaev EC, Chuchalin AG, Varfolomeev SD, Nikolaev EN. Proteomic analysis of exhaled breath condensate for diagnosis of pathologies of the respiratory system. Biomed Khim (Биомедицинская химия). 2015 Nov; 61(6):777-780. doi: 10.18097/PBMC20156106777.

 

16 статей в зарубежных  журналах:

 

Yury Kostyukevich, Alexey Kononikhin, Igor Popov, Natalia Starodubtzevad, Stanislav Pekov, Eugene Kukaev, Maria Indeykina, Eugene Nikolaev: Letter: Analytical potential of the in-electrospray ionization source hydrogen/deuterium exchange for the investigation of oligonucleotides. European Journal of Mass Spectrometry 01/2015; 21(1):59-63. DOI:10.1255/ejms.1330

 

YuryKostyukevich, Alexey Kononikhin, Igor Popov, Maria Indeykina, Sergey A Kozin, Alexander A Makarov, Eugene Nikolaev: Supermetallization of peptides and proteins during electrospray ionization. JOURNAL OF MASS SPECTROMETRY 05/2015; 50(9). DOI:10.1002/JMS.3622

 

Kononikhin, Alexey; Zhvansky, Evgeny; Shurkhay, Vsevolod; Popov, Igor; Bormotov, Denis; Indeykina, Mariya; Karchugina, Sofiia; Kostyukevich, Yury; Bugrova, Anna; Starodubtseva, Natalia; Potapov, Alexander; Nikolaev, Eugene. A novel direct spray-from-tissue ionization method for mass spectrometric analysis of human brain tumors// Anal Bioanal Chem. 2015 Oct;407(25):7797-805. doi: 10.1007/s00216-015-8947-0.

 

Rosenfeld , A. Bychkova, A. Shchegolikhin, V. Leonova, M. Biryukova, E. Kostanova. Induced oxidative modification of plasma and cellular fibrin-stabilizing factor. PROTEIN SCIENCE Volume: 24 Special Issue: SI   Supplement: 1   Pages: 311-311   Meeting Abstract: PL-083. WOS:000363658100522. IF=2.854.

 

Kostyukevich, Y., Kononikhin, A., Popov, I., & Nikolaev, E. (2015). Conformations of cationized linear oligosaccharides revealed by FTMS combined with in‐ESI H/D exchange. Journal of Mass Spectrometry, 50(10), 1150-1156. WOS:000362887100008. IF= 2.379.

 

Zherebker, A. Y., Airapetyan, D., Konstantinov, A. I., Kostyukevich, Y. I., Kononikhin, A. S., Popov, I. A., Kirill V. Zaitsev a, Eugene N. Nikolaev, Perminova, I. V.. Synthesis of model humic substances: a mechanistic study using controllable H/D exchange and Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectrometry //Analyst. – 2015, ANALYST  Volume: 140   Issue: 13   Pages: 4708-4719.

 

Kostyukevich, Y., Zhdanova, E., Kononikhin, A., Popov, I., Kukaev, E., & Nikolaev, E. (2015). Observation of the multiple halogenation of peptides in the electrospray ionization source. Journal of Mass Spectrometry, 50(7), 899-905.

 

Belogurov, A., Kuzina, E., Kudriaeva, A., Kononikhin, A., Kovalchuk, S., Surina, Y., Ivan Smirnov, Yakov Lomakin, Anna Bacheva, Alexey Stepanov, Yaroslava Karpova, Yulia Lyupina, Oleg Kharybin, Dobroslav Melamed, Natalia Ponomarenko, Natalia Sharova, Eugene Nikolaev, Gabibov, A. (2015). Ubiquitin-independent proteosomal degradation of myelin basic protein contributes to development of neurodegenerative autoimmunity. The FASEB Journal, 29(5), 1901-1913.

 

Pastushkova, L. H., Kononihin, A. S., Tijs, E. S., Obraztsova, O. A., Dobrokhotov, I. V., Ivanisenko, V. A., Nikolaev EN, Larina, I. M. (2015). [Identification of biological processes on the composition of the urine proteome cosmonauts on the first day after long space flights]. Rossiiskii fiziologicheskii zhurnal imeni IM Sechenova/Rossiiskaia akademiia nauk, – 2015. – Т. 101. – №. 2. – С. 222-237.

 

Nikolaev E. N. Some notes about FT ICR mass spectrometry //International Journal of Mass Spectrometry. – 2015. – Т. 377. – С. 421-431.

 

Feldman, T. B., Yakovleva, M. A., Arbukhanova, P. M., Borzenok, S. A., Kononikhin, A. S., Popov, I. A., Evgeny N. Nikolaev, Ostrovsky, M. A. (2015). Changes in spectral properties and composition of lipofuscin fluorophores from human-retinal-pigment epithelium with age and pathology. Analytical and bioanalytical chemistry, 407(4), 1075-1088.

 

Larina, I. M., Pastushkova, L. K., Tiys, E. S., Kireev, K. S., Kononikhin, A. S., Starodubtseva, N. L., Popov, Igor A; Custaud, Marc-Antoine; Dobrokhotov, Igor V; Nikolaev, Evgeny N; Kolchanov, Nikolay A, Ivanisenko, V. A. (2015). Permanent proteins in the urine of healthy humans during the Mars-500 experiment. Journal of bioinformatics and computational biology, 13(01), 1540001.

 

Vladimirov, G., Kostyukevich, Y., Hendrickson, C. L., Blakney, G. T., & Nikolaev, E. (2015). Effect of magnetic field inhomogeneity on ion cyclotron motion coherence at high magnetic field. European Journal of Mass Spectrometry, 21(3), 443-449.

 

Kostyukevich, Y., Kononikhin, A., Popov, I., & Nikolaev, E. (2015). Observation of the 16 O/18 O exchange during electrospray ionization. European Journal of Mass Spectrometry, Volume: 21   Issue: 2   Pages: 109-113   Published: 2015.

 

Kostyukevich, Y., Kononikhin, A., Popov, I., Starodubtzeva, N., Pekov, S., Kukaev, E., ... & Nikolaeva, E. (2015). Analytical potential of the in-electrospray ionization source hydrogen/deuterium exchange for the investigation of oligonucleotides. Eur. J. Mass Spectrom. 21, 59–63 (2015).

 

Kostyukevich, Y., Kononikhin, A., Popov, I., Spasskiy, A., & Nikolaev, E. (2015). In ESI‐source H/D exchange under atmospheric pressure for peptides and proteins of different molecular weights from 1 to 66 kDa: the role of the temperature of the desolvating capillary on H/D exchange. Journal of Mass Spectrometry, 50(1), 49-55.

ЛАБОРАТОРИЯ ТЕРМОДИНАМИКИ БИОСИСТЕМ

Лаборатория термодинамики биосистем

Заведующий – д. б. н., профессор Розенфельд Марк Александрович

Телефон: (495) 939-79-30

 

М.А. Розенфельд – доктор биологических наук (1982), профессор (1983), работает в ИБХФ РАН с момента основания института в 1996 г., до 1996 г. работал в ИХФ АН СССР / РАН, начиная с 1965 г. Области научных интересов - биохимическая физика, структура и функция белков системы свертывания крови, свободнорадикальное окисление, окислительная модификация белков, биоантиоксиданты, полифункциональные белковые покрытия на поверхности макро- и нанообъектов.

 

Основные направления исследований

 

  • Структура и функция белков системы свертывания крови;
  • Свободнорадикальное окисление белков;
  • Связь окислительной химической и структурной модификации белков с механизмом их функционирования;
  • Химические и биологические модели генерации и идентификации свободных радикалов;
  • Самосборка надмолекулярных белковых ансамблей;
  • Биоантиоксиданты;
  • Полифункциональные белковые покрытия на поверхности макро- и нанообъектов.

 

Научная тематика лаборатории развивается по двум направлениям. Первое направление касается свободнорадикальной окислительной модификации белков крови. В основе этого направления лежит предложенная принципиально новая концепция о наличии в структуре белков так называемых антиоксидантных структурных элементов (доменов, субдоменов, полипептидных цепей), которые являются перехватчиками активных форм кислорода (АФК), защищая тем самым ключевые аминокислотные остатки от токсического действия АФК. Результаты, полученные по индуцированному окислению плазменного, клеточного фибринстабилизирующего фактора и фибриногена (Rosenfeld, M.A.at. al. Ozone-Induced Oxidative Modification of Plasma Fibrin-Stabilizing Factor. BBA. 2013. V. 1834. P. 2470-2479; Rosenfeld, M.A. et al. Ozone-Induced Oxidative Modification of Fibrinogen: Role of the D Regions. Free Radic. Biol. Med. 2014. V. 77. P. 106-120; Розенфельд М.А. и др. Окислительная модификация клеточного фибринстабилизирующего фактора. ДАН. 2015, в печати), свидетельствуют в пользу такой гипотезы.

Второе направление исследований связано с созданием ковалентно сшитых белковых покрытий на поверхности макро- и нанообъектов, необходимых для целей биологии и медицины (Бычкова А.В. и др. Многофункциональные биосовместимые покрытия на магнитных наночастицах. Успехи химии, 2012, Т. 81, № 11, С. 1026-1050). На основе фундаментальных исследований по свободнорадикальному окислению белков и исследований взаимодействия белков крови с наночастицами (Бычкова А.В. и др. Взаимодействие фибриногена с наночастицами магнетита. Биофизика. 2010. Т. 55. № 4. С. 605–611) был создан новый, не имеющий аналогов, способ создания белковых покрытий на поверхности металлов переменной валентности с сохранением их функциональных свойств (Патент РФ на изобретение № 2484178 от 10.06.2013. Способ получения белковых покрытий на поверхности твердых тел, содержащих ионы металлов переменной валентности). Исследования нацелены на создание моно-, би- и многокомпонентных покрытий.

Результаты исследований лаборатории были доложены на крупных международных симпозиумах: International Factor XIII Workshop. Debrecen, Hungary, 2012; 8th Annual Meeting Society of Thrombosis and Haemostasis. Vienna, Austria, 2014; XXIIIRD International Fibrinogen Workshop. Marseille, France, 2014; 29th Annual Symposium of The Protein Society, Barcelona, Spain, 2015.

 

Состав лаборатории

 

Бирюкова Марина Игоревна, инж.-исс.;

Бычкова Анна Владимировна, к.х.н., н.с.;

Васильева Александра Дмитриевна, аспирант;

Васильева Мария Викторовна, н.с.;

Костанова Елизавета Алексеевна, к.б.н., ст.н.с.;

Леонова Вера Борисовна, н.с.;

Розенфельд Марк Александрович, д.б.н., профессор, зав. лаб.

 

15 избранных публикаций

  1. Rosenfeld, M.A.; Vasileva, M.V. Mechanism of aggregation of fibrinogen molecules: the influence of fibrin-stabilizing factor. Biomed. Sci. 1991. V. 2. Р. 155–161.
  2. Khavkina, L.S.; Rosenfeld, M.A.; Leonova, V.B. Mechanism of inhibition of fibrinolysis and fibrinogenolysis by the end fibrinogen degradation products. Thromb. Res. 1995. V. 78. Р. 173–187.
  3. Розенфельд М.А., Леонова В.Б., Разумовский С.Д., Константинова М.Л. Самосборка молекул мономерного фибрина и агрегация фибриногена под действием озона. Биохимия. 2009. Т. 74. №. 1. С. 54 – 61.
  4. Розенфельд М.А., Леонова В.Б., Щеголихин А.Н., Разумовский С.Д., Константинова М.Л., Бычкова А.Н., Коварский А.Л. Окислительная модификация фрагментов D и E фибриногена. Биохимия. 2010. Т.75. С. 1452-1461.
  5. Бычкова А.В., Сорокина О.Н., Коварский А.Л., Шапиро А.Б., Розенфельд М.А. Взаимодействие фибриногена с наночастицами магнетита. Биофизика. 2010. Т.55. № 4. С. 605-611.
  6. Розенфельд М.А., Леонова В.Б., Бирюкова М.И., Васильева М.В. Самосборка растворимых несшитых и перекрестно-сшитых олигомеров фибрина. Биохимия. 2011. Т. 76. №10. С. 1416-1427.
  7. Бычкова А.В., Сорокина О.Н., Розенфельд М.А., Коварский A.Л. Многофункциональные биосовместимые покрытия на магнитных наночастицах. Успехи химии. 2012. Т. 81. № 11. С. 1026-1050.
  8. Патент РФ на изобретение № 2484178 от 10.06.2013. Заявка на Патент РФ № 2011136972, приоритет от 08.09.2011. Розенфельд М.А., Бычкова А.В., Сорокина О.Н., Коварский А.Л., Леонова В.Б., Ломакин С.М., Макаров Г.Г. Способ получения белковых покрытий на поверхности твердых тел, содержащих ионы металлов переменной валентности.
  9. Бычкова А.В., Розенфельд М.А., Леонова В.Б., Сорокина О.Н., Ломакин С.М., Коварский А.Л. Свободнорадикальное сшивание молекул сывороточного альбумина на поверхности наночастиц магнетита в водной дисперсии. Коллоидный журнал, 2013. Т.75. № 1. С. 9-16.
  1. Розенфельд М.А., Щеголихин А.Н., Бычкова А.В., Леонова В.Б., Бирюкова М.И., Костанова Е.А., Константинова М.Л. Окислительная модификация фибриногена под действием озона. Биохимия. 2013. Т. 78. № 10. С. 1491-1501.
  2. Rosenfeld, M.A.; Bychkova, A.V.; Shchegolikhin, A.N.; Leonova, V.B.; Biryukova, M.I.; Kostanova, E.A. Ozone-Induced Oxidative Modification of Plasma Fibrin-Stabilizing Factor. BBA - Proteins and Proteomics. 2013. 1834, Issue 12. P. 2470-2479.
  3. Rosenfeld, M.A.; Shchegolikhin, A.N.; Bychkova, A.V.; Leonova, V.B.; Biryukova, M.I.; Kostanova, E.A. Ozone-Induced Oxidative Modification of Fibrinogen: Role of the D Regions. Free Radic. Biol. Med. V. 77. P. 106-120.
  4. Бычкова А.В., Пронкин П.Г., Сорокина О.Н., Татиколов А.С., Розенфельд М.А. Исследование сшитых по свободнорадикальному механизму белковых покрытий на магнитных наночастицах методом спектрально-флуоресцентных зондов. Коллоидный журнал. Т. 76. № 4. С. 420–428.
  5. Rosenfeld, M.A., Leonova, V. B., Shchegolikhin, A. N., Bychkova, A.V., Kostanova, E.A., M.I.  Covalent structure of single-stranded fibrin oligomers cross-linked by FXIIIa. Biochem. Biophys. Res.Comm. 2015. V. 461. Р. 408-412.
  6. Розенфельд М.А., Разумовский С.Д., Щеголихин А.Н., Константинова М.Л., Сультимова Н.Б., Козаченко А.И., Наглер Л.Г., Бычкова А.В., Леонова В.Б. Природа активных промежуточных частиц в процессах озон-индуцированного окисления фибриногена Доклады Академии наук. Т. 461. № 6. С. 729–732.

 

Публикации сотрудников лаборатории термодинамики биосистем за 2015 год (зав. лаб. М.А. Розенфельд)

 

- опубликованные статьи: 7 статей

(из них - 5 в российских, 2 в иностранных журналах)

 

  1. М.А. Розенфельд, С.Д. Разумовский, А.Н. Щеголихин, М.Л. Константинова, Н.Б. Сультимова, А.И. Козаченко, Л.Г. Наглер, А.В. Бычкова, В.Б. Леонова. Природа активных промежуточных частиц в процессах озон-индуцированного окисления фибриногена Доклады Академии наук 2015 т. 461, № 6, С. 729–732. / M. A. Rosenfeld, S. D. Razumovskii, A. N. Shchegolikhin, M. L. Konstantinova, N. B. Sultimova, A. I. Kozachenko, L. G. Nagler, A. V. Bychkova, and V. B. Leonova. Nature of Active Intermediate Particles Formed During Ozone-Induced Oxidation. Doklady Biochemistry and Biophysics, (ИФ по 2014 JCR Science Edition 0.343.) 2015, Vol. 461, pp. 139–141. DOI: 10.1134/S1607672915020180 WOS:000354050700019
  1. М. А. Розенфельд, В. Б. Леонова, А. В. Бычкова, Е. А. Костанова, М. И. Бирюкова. Продольная ориентация перекрестно сшитых полипептидных γ цепей в фибриновых фибриллах. Доклады академии наук, 2015. том 464, № 2, с. 234-237. DOI: 10.7868/S0869565215260254 / M. A. Rosenfeld, V. B. Leonova, A. V. Bychkova, E. A. Kostanova, and M. I. Biryukova. Longitudinal Orientation of Cross-Linked Polypeptide γ Chains in Fibrin Fibrils. Doklady Biochemistry and Biophysics, (ИФ по 2014 JCR Science Edition 0.343.) 2015, Vol. 464, pp. 286–289. DOI: 10.1134/S1607672915050051.
  1. П.Г. Пронкин, О.Н. Сорокина, А.В. Бычкова, М.Н. Колганова, А.Л. Коварский, М.А. Розенфельд, А.С. Татиколов. Перенос энергии электронного возбуждения между молекулами цианиновых красителей в комплексе с белком и в системах магнитных наночастиц с белковыми покрытиями. Химия высоких энергий. 2015. Т. 49, № 1, с. 26–31. / P. G. Pronkin, O. N. Sorokina, A. V. Bychkova, M. N. Kolganova, A. L. Kovarskii, M. A. Rozenfel’d, A. S. Tatikolov. Electronic Excitation Energy Transfer between Molecules of Cyanine Dyes in a Complex with Protein and in Systems of Magnetic Nanoparticles with Protein Coatings. High Energy Chemistry. (ИФ по 2014 JCR Science Edition 0.898.) 2015. Vol. 49, No. 1, pp. 24–29. ISSN: 0018-1439 DOI: 10.1134/S0018143915010105 WOS:000346856000004 Scopus: 2-s2.0-84920287591
  1. Бычкова А.В., Иорданский А.Л., Коварский А.Л., Сорокина О.Н., Косенко Р.Ю., Маркин В.С., Филатова А.Г., Гумаргалиева К.З., Роговина С.З., Берлин А.А. Магнитоанизотропные нанокомпозиты для контролируемого высвобождения лекарственных веществ: магнитные и транспортные характеристики. Российские нанотехнологии. 2015, Т. 10, номер 3-4, С. 132-139. / A.V. Bychkova, A.L. Iordanskii, A.L. Kovarskii, O.N. Sorokina, R.Yu. Kosenko, V.S. Markin, A.G. Filatova, K.Z. Gumargalieva, S.Z. Rogovina, A.A. Berlin. Magnetic and Transport Properties of Magneto-Anisotropic Nanocomposites for Controlled Drug Delivery. Nanotechnologies in Russia. 2015, Vol. 10, Nos. 3–4, pp. 325–335. ISSN 1995-0780 DOI: 10.1134/S199507801502007X Scopus: 2-s2.0-84928807440
  1. В.Е. Прусаков, Ю.В. Максимов, К.Н. Нищев, А.В. Голубьев, А.Л. Иорданский, А.В. Бычкова, Ю.Ф. Крупянский, академик А.А. Берлин. Исследование магнитных нанокластеров оксида железа в биокомпозите на основе поли (3-гидроксибутирата) и хитозана методом мессбауэровской спектроскопии. Доклады академии наук. 2015, том 463, № 5, С. 563-565. DOI: 10.7868/S0869565215230164 / V. E. Prusakov, Yu. V. Maksimov, K. N. Nishchev, A. V. Golubiev, A. L. Iordanskii, A. V. Bychkova, Yu. F. Krupyanskii, and Academician A. A. Berlin. Mössbauer Spectroscopy Study of Magnetic Iron Oxide Nanoclusters in a Biocomposite Based on Poly(3-hydroxybutyrate) and Chitosan. Doklady Physical Chemistry, (ИФ по 2014 JCR Science Edition 0.586.) 2015, Vol. 463, Part 2, pp. 176–178. DOI: 10.1134/S0012501615080047
  1. M.A. Rosenfeld, V.B. Leonova, A.N. Shchegolikhin, A.V. Bychkova, E.A. Kostanova, and M.I. Biryukova. Covalent Structure of Single-Stranded Fibrin Oligomers Cross-Linked by FXIIIa. Biochemical and Biophysical Research Communications. (ИФ по 2014 JCR Science Edition 2.297.) Volume 461, Issue 2, 29 May 2015, Pages 408–412. DOI: 10.1016/j.bbrc.2015.04.052 WOS: 000355056900035 Scopus: 2-s2.0-84937761986.

  2. A.M. Holban, A. Iordanskii, A.M. Grumzescu, A. Bychkova,  E. Andronescu, L. Mogoantă,  G.D. Mogoșanu , F. Iordache. Prosthetic devices with nanostructurated surfaces for increased resistance to microbial colonization. Current Pharmaceutical Biotechnology, Special issue: Antimicrobial Strategies Based on Natural Products: Recent Progress in Bio and Nanotechnology, 2015. (Impact Factor 2014 = 1.95) Vol. 16, Number 2, Pp: 112 - 120 DOI: 10.2174/138920101602150112150303   WOS: 000349389400004 Scopus: 2-s2.0-84926151693

    

 

- опубликованные статьи в монографиях, сборниках трудов:

  1. P. G. Pronkin, A. V. Bychkova, O. N. Sorokina, A. S. Tatikolov, A. L. Kovarskii, and M. A. Rosenfeld. Synthesis and Spectral-Fluorescent Study of Protein Coatings on Magnetic Nanoparticles Using Carbocyanine Dyes. Journal of Nature Science and Sustainable Technology. 2015. Vol. 9. № 3. 1- 13.

  2. M.A. Rosenfeld, V.B. Leonova, A.V. Bychkova, M.I. Biryukova, M.V. Vasileva. Structural lability of fibrinogen and its D and E regions induced by free radical-mediated oxidation. In book: Medicine Research Summaries. Volume 10 (with Biographical Sketches), Chapter: Chapter 50, Publisher: Nova Science Publishers, Editors: Zhongwen Liáng and Bibao Zhang. 2015. Pp. 135-136.

  3. B. M. Rumyanysev, S. B. Bibikov, V. I. Berendyaev, A. L. Kovarsky, O. N. Sorokina, A. V. Bychkova, V. G. Leontiev, and L. N. Nikitin. Chapter 21. Magnetic Nanoparticles Effect on Photoelectric Sensitivity and Photoconduction of Polymer Composites. The Chemistry and Physics of Engineering Materials. Editors: Alexandr A. Berlin, Roman Joswik, Vatin Nikolai Ivanovich. Apple Academic Press, Inc. Volume 1 Modern Analytical Methodologies. July 29, 2015. 394 Pages - 140 B/W Illustrations  ISBN 9781771880794

 

- главы в коллективных монографиях:

 

  1. M.A. Rosenfeld, V.B. Leonova, A.V. Bychkova, M.I. Biryukova, M.V. Vasileva. Structural lability of fibrinogen and its D and E regions induced by free radical-mediated oxidation. In book: Medicine Research Summaries. Volume 10 (with Biographical Sketches), Chapter: Chapter 50, Publisher: Nova Science Publishers, Editors: Zhongwen Liáng and Bibao Zhang. 2015. Pp. 135-136.

  2. B. M. Rumyanysev, S. B. Bibikov, V. I. Berendyaev, A. L. Kovarsky, O. N. Sorokina, A. V. Bychkova, V. G. Leontiev, and L. N. Nikitin. Chapter 21. Magnetic Nanoparticles Effect on Photoelectric Sensitivity and Photoconduction of Polymer Composites. The Chemistry and Physics of Engineering Materials. Editors: Alexandr A. Berlin, Roman Joswik, Vatin Nikolai Ivanovich. Apple Academic Press, Inc. Volume 1 Modern Analytical Methodologies. July 29, 2015. 394 Pages - 140 B/W Illustrations 

ЛАБОРАТОРИЯ ГАЗОВОГО АНАЛИЗА И ЭКОТОКСИМЕТРИИ

Лаборатория газового анализа и экотоксиметрии

Заведующий -  д.х.н. Евгений Николаевич Александров

Телефоны: раб. +7-495-939-73-18; моб. +7-919-990-53-43

 

Е.Н. Александров получил геологическое образование в НГРТ  (г. Новочеркасск,1956 г.) и в МФТИ по специальности «Химия быстропротекающих процессов» (г. Долгопрудный, 1967 г.). В период 1956-1961 г.г. Е.Н. Александров  работал техником-геологом в Приаральской экспедиции №9, а с 1967г.  по 2015г. - в ИХФ и ИБХФ РАН в диапазоне должностей от м.н.с. до заведующего отделом. Область научных интересов - химия свободнорадикальных процессов, геохимия, экологическая безопасность.

 

Основные  направления исследований:

-экспериментальное и теоретическое исследование нелинейных гетерогенных факторов при воспламенении и горении водородно-кислородных смесей, реагирующих с мелкодисперсными металлическими и борсодержащими порошками.

- разработка технологии обработки скважин на нефтяных и газовых месторождениях с помощью мягкого термогазодинамического воздействия на продуктивные пласты; разработка  технологий добычи трудно извлекаемых и «неизвлекаемых» запасов нефти; создание  биотехнологического способа восстановления почвы, загрязненной нефтепродуктами;

- исследование радикальных цепных процессов (РЦП) при активном взаимодействии атомов и радикалов  с поверхностью реактора;

- изучение воздействия атмосферы на поверхность летательного аппарата при числе Маха 10-15;

- разработка новых методов генетики и селекции, направленных на профилактическую защиту окружающей среды от сельскохозяйственных ядохимикатов; создание  новых сортов озимой пшеницы методом химического мутагенгеза; внедрение мутантных сортов озимой пшеницы им. И.А. Раппопорта с повышенными хлебопекарными качествами;

 

В  1972-1986 годах с целью выяснения  причин расхождений теории и эксперимента на 1-м и 3-м пределах воспламенения смесей водорода и фосфора с кислородом создана кинетическая резонансно - флуоресцентная спектроскопия  (РФС) разреженных пламен, повысившая чувствительность регистрации параметров РЦП на 5 порядков. При помощи РФС выяснены причины расхождений и завершилась многолетняя дискуссия  с участием двух лауреатов Нобелевской премии.

В 1999-2013 годах создана новая технология добычи нефти из истощенных и  нерентабельных пластов с помощью реакций бинарных смесей. Технология  в 2013 г. успешно применена в США  на месторождении Eastland (США) и опередила по рентабельности ведущие технологии США и Канады.

Традиционное  участие лаборатории в Программе, совместной с ЦАГИ им. Жуковского (1984 г. – 2015 г.г.) по изучению процессов взаимодействия воздуха и летательного аппарата, входящего в атмосферу Земли со сверхзвуковой скоростью (число Маха 10-15). При изучении нагрева поверхности аппарата  в зоне ударной волны в воздухе был оценен вклад в тепловой поток  процессов диссоциации O2 и N2 и рекомбинации атомов O и N на поверхности аппарата, контактирующей с плазмой. 

Традиционное направление, которое включает природоохранную  разработку новых сортов озимой пшеницы  сотрудниками лаборатории - учениками чл.– корр.  РАН  И. А. Рапопорта.  Новые сорта в  России и Казахстане ныне выращивают на 12 тыс. гектаров.

Направление, связанное с разработкой  биотехнологического способа восстановления почвы, сильно загрязненной нефтепродуктами.  Вайсфельд Л.И. и Бекузаровой С.А. (Горский университет) разработан и зарегистрирован  Патент РФ «Способ воспроизводства нефтезагрязненных земель» № 2014109977, (приоритет - с 14.03.2014);

 

Состав лаборатории.:

Козлов Сергей Николаевич – ст. н. с., к. ф.-м. н. – зам. зав. лабораторией

Маркевич  Елена  Андреевна - н. с.  к. х. н.

Сажина Наталья Николаевна - ст. н. с., к. ф.-м. н.

Вайсфельд Лариса Ильинична -  ст. н. с.

Эйгес  Наталья Сергеевна  -  н. с.

Волченко Георгий Александрович – инженер - исследователь

Комиссарова  Алла Анатольевна - инженер - исследователь

Серкин  Юрий Георгиевич - инженер – исследователь

Ширяев П.А. – н.с.

Самусенко А. Л. - н.с

 

Список избранных публикаций:

  1. Александров Е.Н., Козлов С.Н. Гетерогенное развитие цепей в разреженном пламени гремучей смеси. // Доклады Академии наук, физическая химия 2004, том 399, № 5, с.640 – 643.
  1. Александров Е.Н., Козлов С.Н., Кузнецов Н.М. Количественное описание разреженного пламени гремучей смеси с учетом гетерогенного взаимодействия цепей.// Доклады Академии наук, 2005, т. 402, № 4, с. 492-495.
  1. Е.Н. Александров, С.Н. Козлов, Н.М. Кузнецов  Взаимодействие газофазного разреженного пламени с гетерогенными каталитическими процессами, протекающими на поверхности реактора. // Доклады Академии наук, физическая химия 2006, том 407, №,  с.630 – 633.
  1. Е.Н. Александров, Н.М. Кузнецов, С.Н. Козлов, Инициирование поверхностью реактора цепного и теплового взрывов. Критерий участия разветвленных цепей в тепловом взрыве. // Физика горения и взрыва, 2007, т.43, № 5, стр.1-8
  2. Александров Е.Н., Маркевич Е.А., Кузнецов Н.М., Козлов С.Н., Частухин Д.С// Вырожденный взрыв гремучего газа на третьем пределе воспламенения инициируемый продуктами гетерогенной реакции на малоактивном катализаторе (кварце) // Физика горения и взрыва, 2013, т.49, № 1, стр.62 - 69.
  1. Александров Е.Н., Жестков Б.Е., Козлов С.Н. //Одновременное определение вероятности рекомбинации атомов азота и кислорода на кварце.// Теплофизика высоких температур,……..
  1. Эйгес Н. С. Мутагенный эффект разных концентраций этиленимина на озимой пшенице // Экспериментальный мутагенез у сельскохозяйственных растений и его использование в селекции. Труды Московского общества испытателей природы (МОИП). Москва. 1966. Т. 23. С. 66 – 78.
  2. Эйгес Н. С., Мартынюк В. В. Жизнеспособность, константность и фертильность мутантов озимой пшеницы, полученных при действии этиленимина. // Химический мутагенез и создание селекционного материала. Москва. Наука. 1972. С. 220 – 230.
  3. Эйгес Н. С. Влияние ПАБК на сорта озимой пшеницы в условиях производственного опыта. // Химические мутагены и парааминобензойная кислота в повышении урожайности сельскохозяйственных растений. Москва. Наука. 1989. С. 38 – 64.
  4. Эйгес Н. С. Изучение разных способов обработки ПАБК ярового ячменя в хозяйствах Ногинского района Московской области. // Химические мутагены и парааминобензойная кислота в повышении урожайности сельскохозяйственных растений. Москва. Наука. 1989. С. 99 – 123.
  5. Бекузарова С.А., Вайсфельд Л.И., Александров Е.А. Восстановление почвы после загрязнения нефтепродуктами. /Тезисы на Международной научно-практической конференции «Биотехнология и качество жизни» (март 2014) в рамках Конгресса «Биотехнология: состояние и перспективы развития» при поддержке Департамента Науки и Предпринимательства Правительства Москвы. 2014. С. 397-398.
  6. Бекузарова С.А., Вайсфельд Л.И., Александров Е.А. Меры по рекультивации территорий, загрязненных углеводородами нефтяных разливов. /Тезисы докладов V Международной конференции «Окружающая среда и менеджмент природных ресурсов» (1-3 октября 2014). Секция 2. Биоиндексация состояния природных сред. Экотоксиканты и их круговорот в абиотических средах, воздействия на организм, популяции, сообщества. Совместный Российско-финляндский проект SASCHA. Организаторы: ТюмГУ, Тюмень, Россия, Вестфальский университет имени Вильгельма, Германия, Университет Хельсинки, Финляндия. Тюмень. Издательство Тюменского государственного университета. 2014. P. 33-35.

 

Публикации сотрудников лаборатории газового анализа и экотоксиметрии за 2015 год (зав. лаб. Е.Н. Александров)

 

В иностранных изданиях:

1.Эйгес Н.С., Волченко Г.А., Волченко С.Г. Метод химического мутагенеза И.А.

Рапопорта в создании комплексов ценных признаков и биоразнообразия у озимой 

пшеницы. // Scienci, Technology and life – 2014. Proseedings of the international scientific conference Czrech Republic Karlovy Vary 27 – 28. December 2014. Karlovy Vary – Kirov. 2015. С. 117 – 126. ISBN 978-80-87940-87-7. (Skleněný Můstek, Karlovy Vary, Czch Republic). ISBN 978-5-00090-048-2 (MCNIP in LLC. Kirov Russian Federation.

 

2.Эйгес Н.С., Волченко Г.А., Волченко С.Г. Устойчивость к неблагоприятным факторам внешней среды, полученная с использованием метода химического мутагенеза на озимой пшенице. // Международная конференция, «III Весенние научные чтения». 2-ая часть. Харьков 14 марта 2015. Сборник докладов. Украина. Харьков. С. 49 – 55. ISSN 6827-0151.

 

- в российских изданиях: Материалы конференций.

  1. Эйгес Н.С., Волченко Г.А., Волченко С.Г., Ханов В.Г., Кузнецова. Н.Л., Упелниек В.П. Методы получения продовольственного качества у озимой пшеницы. // VIII Московский Международный Конгресс БИОТЕХНОЛОГИЯ. Состояние и перспективы развития. Материалы конгресса часть II. 17 – 20 марта. 2015. Москва. 2015. С. 23 – 25. ISSN 2312-640x. С переводом на английский.

  2. Eiges N.S., Volchenko G.A., Volchenko S.G., Hanov V.G., Kuznecova. N.L., Upelniek V.P. The methods for receive food quality on winter wheat. // VIII Moscow International Congress «BIOTECHNOLOGY: state of the art and prospects of development». Congress proceedings. Part II. P. 23 – 25.

  3. Н.С. Эйгес, Г.А. Волченко, С.Г. Волченко, Е.Н. Александров. Выносливость хемомутантов и хемомутантных сортов и образцов озимой пшеницы к неблагоприятным условиям внешней среды. Связь с экологией. // Актуальные проблемы экологии и сохранения биоразнообразия России и сопредельных стран. Материалы Всероссийской научной конференции с международным участием 27 – 30 апреля 1915. Вып. XI. Владикавказский Североосетинский Государственный Университет. С. 191 – 193. ISBN 978-5-8336-0853-1.

  4. Эйгес Н.С., Волченко Г.А., Волченко С.Г. Исследование действия антиоксиданта пара-аминобензойной кислоты на зерновые и другие культуры. // Материалы XI Международного симпозиума «Новые и нетрадиционные растения и перспективы их использования». Пущино 15 – 19 июня 2015. Москва. Российский университет дружбы народов. С. 172 – 176. ISBN 978-5-209-06563-0.

  5. Эйгес Н.С., Волченко Г.А., Волченко С.Г. Создание зимостойких хемомутантных сортов озимой пшеницы при ужесточении климата. // Разработка инновационных технологий возделывания сельскохозяйственных культур. Материалы Всероссийской научно-практической конференции, посвященной 105-летию ФГБНУ «Ульяновского НИИСХ» 1 – 2  июля 2015г. Ульяновск УлГТУ. 2015. С. 508 – 513.  ISBN 978-5-9795-1416-1.

  6. Эйгес Н.С., Волченко Г.А., Волченко С.Г., Александров Е.Н., Комисарова А.А. Влияние антиоксиданта пара-аминобензойной кислоты (ПАБК) на культурные растения и другие таксономические единицы. Сохранность окружающей среды и сельскохозяйственной продукции. // Труды IX международной конференции «БИОАНТИОКСИДАНТ». Москва. 2015. Университет Дружбы Народов. С. 329 – 341. ISBN 978-5-209-06790-0.
  1. Вайсфельд Л.И., Арсентьев С.В. Развитие озимой пшеницы под влиянием химического мутагена фосфемида. Международный научно-исследовательский журнал (International Research Journal), № 11 (42). Часть 3. Декабрь. С. 83-90. 2015. Импакт-фактор РИНЦ = 0,198. ISSN 2227-6017 (ONLINE), ISSN 2303-9868 (PRINT), DOI: 10.18454/IRJ.2227-6017. ПИ № ФС 77 – 51217.
  1. Вайсфельд Л.И., Опалко А.И. Рецензия на книгу: Biological systems, biodiversity and stability of plant communities. [Edited byLarissa I. Weisfeld,Anatoly Iv. Opalko, Nina A. Bome, Sarra A. Bekuzarova. The reviewer Gennady E. Zaikov]. Apple Academic Press Inc. – 2015. / Международный научный журнал «Globus». Мультидисциплинарный сборник III Международной научно-практической конференции «Достижения и проблемы современной науки”. Выпуск 3. Том 3. Публикация 03 декабря 2015 г. С. 16-18. «Globus». ISSN 2218-2268.

 

Коллективные монографии:

1. Ecological Consequences of Increasing Crop Productivity: Plant Breeding and Biotic Diversity. [Edited by A.I. Opalko, L.I. Weisfeld, S.A. Bekuzarova, N.A. Bome, G.E. Zaikov]. Toronto – New Jersey. Apple Academic Press. 2015.  302 p. ISBN: 978-1-77188-021-1

2. Biological systems, biodiversity and stability of plant communities. [Edited by L.I. Weisfeld, A.I. Opalko, N.A.  Bome, S.A. Bekuzarova. Reviewer and Advisory Board Member G.E. Zaikov] Toronto – New Jersey. Apple Academic Press Inc., 2015. 527 p. ISBN: 978-1-77188-064-0.

3 . Temperate Crop Science and Breeding Ecological and Genetic Studies. Edited by S.A. Bekuzarova,  N.I.  Bome, A.I. Opalko, L.I. Weisfeld, Apple Academic Press. [Reviewer and Advisory Board Member G.E. Zaikov.] 2015. 345p. Hard ISBN: 9781771882255 E-Book, ISBN: 9781771882293

Статьиопубликованные в монографиях:

  1. Weisfeld L.I. About Cytogenetic Mechanism of Chemical Mutagenesis / Ecological Consequences of Increasing Crop Productivity. Plant Breeding and Biotic Diversity. [Edited by Anatoly Iv. Opalko, Larissa I. Weisfeld, Sarra A. Bekuzarova, Nina A. Bome, and Gennady E. Zaikov]. Apple Academic Press Inc. Toronto - New Jersey. USA- Canada. – 2015. – P. 260-269. ISBN 978-1-77188-012-1.
  1. Weisfeld L.I. Importance of Discovery of I. A. Rapoport of Chemical Mutagenesis in the Study of Mechanism of Cytogenetic Effect of Mutagens. / Ecological Consequences of Increasing Crop Productivity. Plant Breeding and Biotic Diversity. [Edited by Anatoly Iv. Opalko, Larissa I. Weisfeld, Sarra A. Bekuzarova, Nina A. Bome, and Gennady E. Zaikov]. Apple Academic Press Inc. Toronto - New Jersey. USA-Canada. – 2015 – P. 271- 275. ISBN 978-1-77188-012-1.
  1. Weisfeld L. I., Opalko A. I., and Zaikov G. E. Introduction / Ecological Consequences of Increasing Crop Productivity. Plant Breeding and Biotic Diversity. Edited by Anatoly Iv. Opalko, Larissa I. Weisfeld.
  1. Bome N.A., A.Ya., Ripberger Е.I., Arsentyev S.V., Weisfeld L.I. A Study of Ecological and Biological Potential and Formation of Gene Pool of Cultural Plants in Institute of Biology of Tyumen State University / Ecological Consequences of Increasing Crop Productivity. Plant Breeding and Biotic Diversity. [Edited by Anatoly Iv. Opalko, Larissa I. Weisfeld, Sarra A. Bekuzarova, Nina A. Bome, and Gennady E. Zaikov]. Apple Academic Press. Toronto New Jersey. – 2015. – P. 57-68. ISBN 978-1-77188-012-1.
  1. Bome N.A., Weisfeld L.I., Bekuzarova S.A., Bome A.Ya. Optimization of the Structurally Functional Changes in the Cultured Phytocoenoses in the Areas with Extreme Edaphic-Climatic Conditions / Biological Systems, Biodiversity, and Stability of Plant Communities. [Edited byLarissa I. Weisfeld,Anatoly Iv. Opalko, Nina A. Bome, Sarra A. Bekuzarova] The reviewer Gennady E. Zaikov]. Apple Academic Press Inc. – 2015. P. 20-30. ISBN 978-1-77188-064-0.

ЛАБОРАТОРИЯ КИНЕТИКИ И МЕХАНИЗМОВ ФЕРМЕНТАТИВНЫХ И КАТАЛИТИЧЕСКИХ РЕАКЦИЙ

Лаборатория кинетики и механизмов ферментативных и каталитических реакций

Зав. лабораторией: член-корр. РАН, д.х.н. Варфоломеев Сергей Дмитриевич

Тел.: (499)137-64-20

email: sdvarf@sky.chph.ras.ru

Варфоломеев С.Д. - окончил Химический факультет МГУ им. М.В. Ломоносова в 1968 г., аспирантуру Химического факультета МГУ им. М.В. Ломоносова в 1971 г,  доктор химических наук с 1979 г., член-корреспондент РАН с 2006 года. Работал заведующим отделом биокинетики Межфакультетской лаборатории биоорганической химии им. А.Н. Белозерского (1978-2001 гг.), с 1988 г. - зав. кафедрой химической энзимологии химического факультета МГУ им. М.В. Ломоносова. В ИБХФ РАН работает с июля 1996 г. зав. лабораторией неравновесных белковых структур. С 2004 г. по июль 2015 г. являлся директором ИБХФ РАН, в настоящее время – научный руководитель ИБХФ РАН, зав. отделом биокатализа и физической химии биопроцессов.

Автор 606 статей, 23 книг, 46 патентов, лауреат премии Ленинского комсомола (1974 г.), лауреат Государственной премии СССР (1984 г.),  премии им. М.В. Ломоносова (2000 г.), член 2 диссертационных советов, член редколлегий 6 журналов. Под его руководством были защищены 32 кандидатских и 11 докторских диссертаций. Руководитель ведущей научной школы «Химическая энзимология».

Область научных интересов: биофизика, молекулярные основы биологического катализа: кинетика ферментативного катализа, биоэлектрокатализ, ферменты и ферментативные системы синтеза физиологически активных соединений, биосенсоры, инженерная энзимология, иммобилизованные ферменты, физическая химия биопроцессов, механизмы ферментативных реакций, физико-химическая биология, биоорганическая химия, биотехнология.

 

 

Основные направления исследований

  • Кинетика и механизм действия, взаимосвязь между структурой и функцией ферментов, полиферментных систем; моделирование биокаталитических ансамблей;
  • Разработка научных основ биоконверсии энергии – способов преобразования энергии на основе биологических принципов и объектов;
  • Разработка методов получения и медицинского применения физиологически активных веществ и модифицированных биологических макромолекул; механизм действия этих веществ в реакциях с ферментами и биологическими системами организма;
  • Разработка научных основ получения и применения металло-комплексных и биоорганических катализаторов для создания новых технологических процессов;
  • Разработка научных основ применения биоорганических катализаторов для получения сахаристых веществ, органических кислот и аминокислот;

 

Лаборатория кинетики и механизмов ферментативных и каталитических реакций была создана в 2007 году на базе лаборатории неравновесных белковых структур, возглавляемой проф. Варфоломеевым С. Д. с 1996 года. Основными направлениями работ лаборатории в 1996 – 2007 гг. являлись: исследование кинетики и механизма коагуляции гемоглобина при использовании солей тяжелых металлов; изучение антиканцерогенной активности белкового ингибитора протеаз из растительного сырья; исследование коллоидных частиц, маркированных биологическими объектами со специфически модифицированной поверхностью для создания биосенсоров нового поколения; исследование физико-химических закономерностей регуляции агрегации тромбоцитов человека под действием новых синтетических соединений; синтез и исследование свойств модельных гибридных фотосинтетических систем. После реорганизации лаборатории основным направлением исследований является изучение физико-химических основ и принципов функционирования биологических макромолекул, регуляторных систем и надмолекулярных систем различной степени сложности, разработка новых методов исследования и их использование в современных высоких наукоемких технологиях в химии, медицине, микробиологии и биотехнологии. В рамках данного направления проводятся следующие исследования: разработка физико-химических основ технологии получения биотоплив: развитие новых методов исследования и использование иммобилизованных полиферментных систем в виде клеток разных микроорганизмов в высоких технологиях переработки органических материалов, энергосбережения и альтернативной энергетики; создание новых фотохромных материалов: разработка гибридных систем, содержащих фотоуправляемые фрагменты и исследование их взаимодействия с мишенями различной природы; синтез новых антиагрегационных средств класса 5-замещенных 3-пиридилизоксазолов и исследование их влияния на процесс агрегации тромбоцитов человека и рецепторы тромбоцитов in vitro; химия зрительного процесса: стереоселективный синтез и разработка прямого метода определения строения хромофорных групп зрительных пигментов; исследование протекания полиферментных процессов в центральной нервной системе путем прямого анализа ключевых метаболитов в мозге человека методами магнитно-резонансной томографии и ядерного магнитного резонанса; математическое моделирование энергетического обмена организма человека и исследование его роли в старении и возникновении патологий; изучение влияния низкоинтенсивных факторов внешней среды на психофизиологические показатели детей и взрослых. Следует отметить, что проводимые в 2004-2011 гг. в рамках Программы РАН исследования по пребиотическому синтезу пептидов и созданию катализаторов на их основе позволили впервые качественно оценить состав получаемых смесей биополимеров в заданных условиях, а также установить первичные последовательности получаемых полимеров при помощи современных методов масс-спектрометрии (С.Д. Варфоломеев Жизнь молекул в экстремальных условиях. Горячий микромир Камчатки. – 2013.- М., URSS, 480 с.).

Лаборатория сотрудничает с рядом лабораторий ИБХФ РАН: лабораторией масс-спектрометрии биомолекул (зав. лаб. – проф. Николаев Е.Н.), лабораторией физико-химических основ рецепции (зав. лаб. – академик РАН Островский М.А.), а также с кафедрой химической энзимологии Химического факультета МГУ им. М. В. Ломоносова и Факультетом фундаментальной медицины МГУ им. М. В. Ломоносова, кафедрой биотехнологии и нанобиотехнологии МИТХТ им. М.В.Ломоносова, Центром фотохимии РАН и лицеем № 17 г. Химки. Сотрудники лаборатории принимают участие в подготовке молодых специалистов ряда указанных вузов, являясь соруководителями курсовых, бакалаврских и магистерских работ, а также руководителями диссертационных работ на соискание степени кандидата наук. За период 1996-2015 гг. лаборатория участвовала в выполнении ряда президентских и федеральных целевых государственных научно-технических программ, Программ Президиума РАН и проектов, включая государственные научно-технические программы «Новейшие методы биоинженерии» (направление «Инженерная энзимология») и "Биокаталитические технологии", 10 Программ фундаментальных исследований Президиума РАН, 7 государственных контрактов в рамках Федеральной целевой научно-технической программы,  Грант Президента РФ ВШ-40, 9 грантов РФФИ, 2 гранта Президента РФ для молодых ученых – кандидатов наук, 6 зарубежных грантов, а также 8 хоздоговоров.  Результаты научных исследований были опубликованы в 172 статьях в журналах, 11 патентах РФ, 7 книгах, 12 сборниках трудов по тематическим программам и 420 тезисах всероссийских и международных конференций, а также представлены в виде 266 стендовых и 140 устных докладов на всероссийских и международных конференциях. В 2007 году был создан макет пилотной комбинированной установки по биотехнологической утилизации особо токсичных веществ и внедрен во ФГУП ГосНИИОХТ. Результаты были также представлены на 8-й специализированной выставке «Изделия и технологии двойного назначения. Диверсификация ОПК» (Москва, ВВЦ, 4 октября 2007 г.), Третьем Всероссийском Форуме-выставке «ГОСЗАКАЗ 2007» (26-26 марта 2007 г., Москва, МВЦ «КрокусЭкспо»), Выставке «Золотая осень» (Ростов, 2007 г.). Сотрудники лаборатории неоднократно принимали участие в ежегодном конкурсе научных работ ИБХФ РАН по химическому и биологическому направлениям, занимая призовые места. В лаборатории были выполнены и защищены 9 диссертаций на соискание степени кандидата химических наук, из них 4 – аспирантами ИБХФ РАН, защищены 2 диссертации на соискание степени доктора наук.

Лаборатория сотрудничает с кафедрой химической энзимологии Химического факультета МГУ им. М.В. Ломоносова при проведении фундаментальных исследований в области биоконверсии энергии и применения биокатализаторов для переработки органического растительного сырья с целью получения целевых органических продуктов (группа проф. Калюжного С.В., группа д.б.н. Ефременко Е.Н.). В результате совместной работы разработана серия оригинальных высокоактивных биокатализаторов (7 шт.) в виде клеток микроорганизмов, иммобилизованных в криогель поливинилового спирта для получения органических кислот (янтарной, яблочной, фумаровой, аспарагиновой) из разнообразного возобновляемого углеводосодержащего сырья, способных функционировать длительное время (до 2000 ч) в различных исходных по характеристикам средах с максимальным выходом целевого продукта до 90% от теоретически возможного уровня. Впервые установлена эффективность использования в качестве сырья гидролизатов целлюлозосодержащей биомассы, биомассы фототрофных микроорганизмов и макроводорослей и глицерина (отхода производства биодизеля) для получения органических кислот с использованием разработанных биокатализаторов. По широте спектра образцов возобновляемого сырья, конвертируемых в фумаровую и янтарную кислоты, разработанные биокатализаторы мировых аналогов не имеют.

Изучение физико-химических основ ферментативного катализа, то есть природы высокой активности и специфичности ферментов проводится совместно с кафедрой химической энзимологии Химического факультета МГУ им. М.В. Ломоносова  и лабораторией квантовой химии биомакромолекул (зав. лабораторией – проф. Немухин А.В.) ИБХФ РАН, с применением математических и квантовых расчетов на основе экспериментальных данных и баз данных по ферментам. Были созданы модели каталитических центров для сериновых протеаз с имитацией всех стадий процесса катализа.

Созданием новых фотохромных материалов: разработкой гибридных систем, содержащих фотоуправляемые фрагменты и исследованием их взаимодействия с мишенями различной природы в лаборатории занимается с.н.с., д.х.н. Ходонов А.А., сотрудничая с кафедрой биотехнологии и нанобиотехнологии МИТХТ им. М.В. Ломоносова. По данной теме были предложены методы синтеза производных фотохромных лигандов спиропиранового и дитиенилэтенового рядов, в том числе и с терминальной тиольной группой, пригодной для иммобилизации фотохромов на поверхности неорганических наночастиц (квантовых точек CdSe), проведено детальное исследование их фотохимии и фотохромного поведения, апробированы пути и условия процесса иммобилизации фотохромных лигандов на поверхности квантовых точек. Полученные результаты показали возможность обратимого управления флуоресценцией квантовых точек посредством обратимой модуляции абсорбционных свойств фотохромного лиганда, с возможностью использования этого типа гибридных материалов как прототипов smart-устройств в нанофотонике, например, в качестве молекулярных оптических переключателей.

            Изучение химии зрительного процесса, включая стереоселективный синтез и разработку прямого метода определения строения хромофорных групп зрительных пигментов, проводится н.с., к.х.н. Беликовым Н.Е. при участии с.н.с., д.х.н. Ходонова А.А. и с.н.с., д.х.н. Деминой О.В. совместно с лабораторией физико-химических основ рецепции ИБХФ РАН (зав. лабораторией – акад. РАН Островский М.А.). Основным достижением является апробация альтернативного варианта синтеза 11Z-изомера ретиналя: сочетанием процесса фотоизомеризации коммерчески доступного all-E-изомера ретиналя с последующим препаративным разделением смеси с помощью ВЭЖХ, с получением набора образцов основных Z-изомеров ретиналя, и разработка метода идентификации микро- и наноколичеств изомеров ретиналя при использовании ВЭЖХ. Получены 2 золотые медали за разработку водорастворимых форм ретиналя: на Московской международной научно-практической конференции «Биотехнология: экология крупных городов» (Москва, 15-17 марта 2010) и Seoul International Invention Fair (SIIF 2010, 2-5 декабря 2010).

Синтезом новых антиагрегационных средств класса 5-замещенных 3-пиридилизоксазолов и исследованием их влияния на процесс агрегации тромбоцитов человека и рецепторы тромбоцитов in vitro занимается группа с.н.с., д.х.н. Деминой О.В. в содружестве с кафедрой биотехнологии и нанобиотехнологии МИТХТ им. М.В. Ломоносова (группа проф., д.х.н. Ходонова А.А.) и ФГБУ «Федеральный научно-клинический центр детской гематологии, онкологии и иммунологии имени Дмитрия Рогачева» Министерства здравоохранения Российской Федерации (лаборатория д.ф.-м.н. Пантелеева М.А. и лаборатория проф. Атауллаханова Ф.И.). По данной теме было синтезировано 57 новых соединений, разработана общая схема синтеза продуктов с возможностью масштабирования, исследованы кинетические закономерности процесса агрегации тромбоцитов человека для 37 соединений, изучен возможный механизм действия этого класса соединений, защищена диссертация на соискание ученой степени доктора химических наук по специальности «Биоорганическая химия» в 2014 году. Получена медаль в конкурсе молодых ученых «Biothech-2011» на VI Московском международном конгрессе Biotechnology: State of the Art and Prospects of Development” (Москва, 21-25 марта 2011 г.). В настоящее время продолжаются исследования взаимодействия этого класса веществ с рецепторами тромбоцитов человека.

            Исследование протекания полиферментных процессов в центральной нервной системе путем прямого анализа ключевых метаболитов в мозге человека методами магнитно-резонансной томографии и ядерного магнитного резонанса проводится в.н.с., д.б.н. Семеновой Н.А. в рамках сотрудничества с ИХФ РАН. Данные исследования необходимы для создания научных основ диагностики и лечения патологических состояний ЦНС. Впервые прижизненно и неинвазивно детально охарактеризована микроструктура проводящих путей, связанных с моторными функциями головного мозга, измерены параметры диффузии тканевой воды и показатели обменных процессов в белом веществе мозга  больных на ранних стадиях юношеской  шизофрении; выявлены особенности микроструктуры важнейшего проводящего пути - кортикоспинального тракта, и показано, что первопричиной  микроструктурных нарушений является повреждение нейронов. Разработана новая методика оценки внутриклеточных концентраций низкомолекулярных веществ при помощи динамической спектроскопии. Метод использован in vivo при исследовании в локусе коры мозге человека кинетики N-ацетиласпартата в периоде гемодинамического ответа на единичный стимул.

            Анализ и математическое моделирование энергетического обмена организма, исследование его роли в старении и возникновении патологий выполняется с.н.с., к.ф.-м.н. Кременцовой А.В. совместно с кафедрой геронтологии и гериатрии РНИМУ им. Пирогова, г. Москва (Терёшина Е.В.). Проведено выявление связи сердечно-сосудистых заболеваний с заболеваниями пищеварительной системы у пожилых людей. Рассмотрены возможные механизмы развития одновременного развития сопутствующих заболеваний. Дальнейшие исследования необходимы для  разработки более щадящих методов комплексной терапии у людей с хроническими заболеваниями.

            Изучение влияния низкоинтенсивных факторов внешней среды на психофизиологические показатели детей и взрослых проводится с.н.с., к.б.н. Хорсевой Н.И. Впервые обобщены данные воздействия электромагнитного излучения радиочастотного диапазона (ЭМИ РЧ) на развивающийся организм с оценкой опасности применения мобильной связи детьми и подростками, а также риска развития нейродегенеративных заболеваний и опухолей мозга у лиц, пользовавшихся мобильными телефонами в детском возрасте (на базе лицея № 17). Приведены рекомендации детям, подросткам и родителям по снижению риска неблагоприятного воздействия. При исследовании была использована компьютерная программа LUM, разработанная Хорсевой Н.И. (ИБХФ РАН) и Григорьевым Ю.Г. (д.м.н., профессор,  Президент РНКЗНИ, член консультативного  Комитета ВОЗ по Международной программе «ЭМП и здоровье населения»))

 

Состав лаборатории:

  1. Варфоломеев С.Д., зав. лабораторией, чл.-корр. РАН, проф., д.х.н.
  2. Беликов Н.Е., н.с., к.х.н.
  3. Бурденный А.М., м.н.с.
  4. Гачок И.В., с.н.с., к.б.н.
  5. Демина О.В., с.н.с., д.х.н.
  6. Ефременко Е.Н., с.н.с., д.б.н.
  7. Лягин И.В., н.с., к.х.н.
  8. Калюжный С.В., в.н.с., д.х.н.
  9. Кременцова А.В., с.н.с., к.ф.-м.н.
  10. Курова В.С., с.н.с., к.х.н.
  11. Семенова Н.А., с.н.с., д.б.н.
  12. Упоров И.В., с.н.с., к.ф.-м.н.
  13. Федорченко К.Ю., н.с.
  14. Ходонов А.А., с.н.с., д.х.н.
  15. Хорсева Н.И., с.н.с., к.б.н.

 

Публикации

  1. Варфоломеев С.Д. Химическая энзимология. Серия классический университетский учебник. Издательский центр «Академия Москва, ISBN 5-7695-1953-3, 480 с. 2005
  2. Варфоломеев С.Д., Гуревич К.Г. Биокинетика. Практический курс.

Фаир-Пресс Москва, ISBN 5-8183-0050-1, 720 с. 1999.

  1. Коллективная монография «Физическая химия биопроцессов» под ред. С.Д. Варфоломеева, «КРАСАНД», Москва, 800 с., 2014 г., ISBN 978-5-396-00585-3.
  2. Демина О.В., Ходонов А.А., Швец В.И., Варфоломеев С.Д. Агрегация тромбоцитов человека: молекулярно-кинетический механизмы и пути регуляции. // Биологические мембраны, 2002.  т. 10, № 2, с. 115-152.
  3. О.В. Демина, А.А. Ходонов, Е.И. Синауридзе, В.И. Швец, С.Д. Варфоломеев. 5-Замещенные пиридилизоксазолы - эффективные ингибиторы агрегации тромбоцитов. // Изв. АН. Сер. Химическая, 2014, № 9, c. 2092-2113
  4. Belikov, M. Yakovleva, T. Feldman, O. Demina, A. Khodonov, M. Lindström, K. Donner, M. Ostrovsky. Lake and sea populations of Mysis relicta (Crustacea, Mysida) with different visual-pigment absorbance spectra use the same A1 chromophore // PLOS One, 2014, V. 9, № 2, e88107
  5. V. Demina, P.P. Levin, N.E. Belikov, A.V. Laptev, A.Yu. Lukin, V.A. Barachevsky, V.I. Shvets, S.D. Varfolomeev, A.A. Khodonov. Synthesis and photochromic reaction kinetics of unsaturated spiropyran derivatives. // J. Photochem. Photobiol. A: Chemistry, 2013, V. 270, P. 60-66.
  6. О.В. Демина, А.В. Лаптев, А.Ю. Лукин, А.А. Ходонов, Н.Е. Беликов, М.А. Фомин, И.В. Грибкова, В.И. Швец, С.Д. Варфоломеев. Сравнение антиагрегационной активности 3-(3-пиридил)-5-фенилизоксазола и 3-(3-пиридил)-5-фенил-1,2,4-оксадиазола. // Биол. Мембраны, 2011, т. 28, No 4, 243-253.
  7. Efremenko E.N., Nikolskaya A.B., Lyagin I.V., Senko O.V., Makhlis T.A., Stepanov N.A., Maslova O.V., Mamedova F.,Varfolomeyev S.D. Production of biofuels from pretreated microalgae biomass by anaerobic fermentation with immobilized Clostridium acetobutylicum cells. // Bioresource Technology, 2012, V. 114, P. 342-348.
  8. Efremenko E.N., Stepanov N.A., Senko O.V., Spiricheva O.V., Varfolomeev S.D. Biocatalysts based on immobilized cells of microorganisms in the production of bioethanol and biobutanol. // Catalysis in Industry. 2011, vol. 3, p. 41-46.
  9. Варфоломеев С.Д., Ефременко Е.Н., Крылова Л.П. Биотопливо //  Успехи химии.
  10. 2010. том 79, № 6, с. 491-509
  11. Nemukhin A.V., Grigorenko B.L., Morozov D.I., Kochetov M.S., Lushchekina S.V., Varfolomeev S.D. On quantum mechanical - molecular mechanical (QM/MM) approaches to model hydrolysis of acetylcholine by acetylcholinesterase. // Chemico-Biological Interactions, 2013, V. 203, No 1, 51-56.
  12. Алексеева О.М., Ерохин В.Н., Кременцова А.В., Миль Е.М., Бинюков В.И., Фаттахов С.Г., Ким Ю.А., Семенов В.А., Голощапов А.Н., Бурлакова Е.Б., Коновалов А.И. «Изучение влияния малых доз мелафена на клетки злокачественных новообразований животных in vivo и in vitro». // ДАН, 2010, т. 431, № 3, с. 408-411
  13. Хорсева Н.И., Григорьев Ю.Г., Горбунова Н.В. Изменение параметров зрительного анализатора детей-пользователей мобильной связью: лонгитюдное исследование. // Радиационная биология. Радиоэкология, 2014, т. , №1, с. 62-71.
  14. Айсина Р.Б., Гулин Д.А., Гершкович К.Б., Варфоломеев С.Д. Стрептокиназа и стафилокиназа: различия кинетики и механизма их взаимодействия с плазминогеном, ингибиторами и фибрином // Биоорганическая химия, 2015. том 41, № 5, с. 565-578.
  15. М.В. Ублинский, Н.А. Семенова, Т.А. Ахадов, И.А. Мельников, С.Д. Варфоломеев. Релаксационная кинетика в исследовании нейробиологических процессов методами функциональной магнитно-резонансной томографии и спектроскопии. // Изв. АН. Сер. Химическая, 2015, № 2, 451-457.

Публикации сотрудников лаборатории кинетики и механизмов ферментативных и каталитических реакций за 2015 год (зав. лаб. С.Д. Варфоломеев)

 опубликованные статьи - 20

- в русских журналах: - 17 

  1. T. Ismayilov, N.A. Stepanov, E.N. Efremenko, V.M. Abbasov. Evaluation of biocidal properties of vegetable oil-based corrosion inhibitors using bioluminescent enzymatic method.// Moscow University Chemistry Bulletin, 2015, 70(4), 197–201.

  2. Е.Н. Ефременко, О.В. Сенько, О.В. Маслова, Н.А. Степанов, И.В. Лягин, И.В. Илушка. Исследование процесса получения фумаровой кислоты под действием клеток мицелиального гриба Rhizopus oryzae.// Современные проблемы науки и образования, 2015, № 2, 1–8.

  3. Е.Н. Ефременко, И.В. Лягин, Д.А. Гудков, Н.А. Степанов, О.В. Сенько, О.В. Маслова, Д.А. Ковалёв, Н.В. Завьялова, В.И. Холстов, А.А. Янковская. Комбинированное применение ферментного и бактериального биокатализаторов в процессах биодеструкции ФОВ и продуктов их разложения. // Теоретическая и прикладная экология, 2015, № 3, 35–39.

  4. Ф. Мамедова, О.В. Сенько, О.В. Маслова, А. Т. Махлис, Е.Н. Ефременко. Получение метана в процессе биотрансформации иммобилизованных клеток мицелиального гриба rhizopus oryzae, использованных для получения молочной кислоты.// Вестник биотехнологии и физико-химической биологии имени Ю.А. Овчинникова, 2015, 11(1), 28–33.

  5. Е.Н. Ефременко, В.В. Завьялов, Н.В. Завьялова, В.И. Холстов, А.А. Янковская. Разрыв С-Р связи в фосфонатах под действием ферментных биокатализаторов.// Теоретическая и прикладная экология, 2015, № 3, 47–53.

  6. М.В. Ублинский, Н.А. Семенова, Т.А. Ахадов, И.А. Мельников, С.Д. Варфоломеев. Релаксационная кинетика в исследовании нейробиологических процессов методами функциональной магнитно-резонансной томографии и спектроскопии. // Изв. АН. Сер. Химическая, 2015, № 2, 451-457 [Russian Chemical Bulletin, 2015, Vol. 64, № 2, p. 451-457]

  7. Ублинский М.В., Семенова Н.А., Луковкина О.В., Сидорин С.В., Лебедева И.С., Каледа В.Г., Бархатова А.Н., Ахадов Т.А. Особенности диффузии в кортикоспинальном проводящем пути у больных на ранней стадии шизофрении по данным диффузионно-тензорной магнитно-резонансной томографии. // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2015, № 1, 36-40.

  8. П.Е. Меньщиков, Н.А. Семенова, М.В. Ублинский, Т.А. Ахадов, Р.А. Кишишян, И.С. Лебедева, М.А. Омельченко, В.Г. Каледа, С.Д. Варфоломеев. Редактирование спектров 1Н МРС. Определение уровня GABA в мозге людей с ультравысоким риском развмимя шизофрении. // Изв. АН. Сер. Химическая, 2015, № 9. C.2238 - 2243.

  9. А. С. Седов, Д. А. Деветьяров, Ю. Н. Семенова, В. В. Завьялова, В. Л. Ушаков, Р. С. Медведник, М. В. Ублинский, Т. А. Ахадов, Н. А. Семенова. фМРТ исследование динамики реакций мозга человека при реализации произвольного движения. // ЖВНД. 2015, т. 65, № 4, 436 - 445.

  10. Шендяпина М.В., Омельченко М.А., Лебедева И.С., Канонович П.С., Семенова Н.А., Мельников И.А., Ублинский М.В., Ахадов Т.А.,  Симонова О.А.,  Каледа В. Г.  Особенности обработки информации и некоторые метаболические характеристики головного мозга у больных из группы ультравысокого риска по развитию эндогенного психоза. // Журнал неврологии и психиатрии им. С.С. Корсакова, 2015, №1, 24-29.

  11. Хорсева Н.И., Григорьев П.Е. Психофизиологические показатели как критерий оценки воздействия низкоинтенсивных естественных и техногенных электромагнитных полей на центральную нервную систему человека. // Биомедицинская радиоэлектроника,  2015, № 6, 57-60.

  12. Хорсева Н.И., Вишневская Л.Л. Показатели кратковременной зрительной памяти у детей-пользователей мобильной связью. // Биомедицинская радиэлектроника, 2015, № 6, 61-65.

  13. Марахова В.А., Хорсева Н.И. Мобильный устройства и здоровье школьников. // Материалы научно-практического семинара "Окружающая среда и здоровье человека", 5 июня 2015 г., г. Симферополь,  с. 26-30.

  14. Хорсева Н.И., Григорьев П.Е.. Захарова И.Е. Дети-пользователи мобильной связью и эффективность коррекционных занятий с учителем-логопедом. // Материалы научно-практического семинара "Окружающая среда и здоровье человека", 5 июня 2015 г., г. Симферополь, с. 39-47.

  15. Alekseeva O.M., Krementsova A.V., Kim Yu.A., Krivandin A.V., Shatalova O.V., Zaikov G.E. Melafen effects to structural parameters of DMPC and egg phopholipids membranes. // Вестник Казанского Технологического Университета, 2015, т. 18, № 2, 14-22.

  16. N. Erokhin, A.V. Krementsova, V.A. Semenov, E.B.Burlakova. Effect of synthetic and natural antioxidants on the emergence and development of malignant tumors. // Вестник Казанского технологического университета, 2015, т.18, №1, 367-370.

  17. Хорсева Н.И., Григорьев Ю.Г. Электромагнитное излучение мобильных телефонов как фактор угрозы здоровью детского населения. // Материалы Пленума Научного совета по экологии человека и гигиене окружающей среды на тему: «Комплексное воздействие факторов окружающей среды и образа жизни на здоровье населения: диагностика, коррекция, профилактика», 11-12 декабря 2014, Москва, с. 433-435.

- в иностранных журналах: - 3

  1. Frančič, I.V. Lyagin, E.N. Efremenko, A. Lobnik. Hybrid sol-gel bio-films: influence of synthetic parameters on behaviour and performance of entrapped his6-tagged organophosphorus hydrolase. //Journal of Sol-Gel Science and Technology, 2015, 74(2), 387–397.

  2. E. Menschikov, M. V. Ublinskii, N. A. SemenovaI. S. Lebedeva, T. A. Akhadov. Lateralization of Glx and GABA metabolic changes in anterior cingulate for Ultra High Risk Schizophrenia patients. // Proc. Intl. Soc. Mag. Reson. Med. 23 (2015)

  3. M. V. Ublinskii, N. A. Semenova, O. V. Lukovkina, S. V. Sidorin, I. S. Lebedeva, T. A. Akhadov. Diffusion in the Corpus Callosum in Patients with Early Schizophrenia. // Exp. Biol. Med., 2015, V. 158, № 5, P. 611-613.

 

 

- главы в монографиях, учебниках, научно-справочных изданиях:

  1. A.V. Krementsova, V.N. Erokhin, V.A. Semenov, and O.M. Alekseeva The Aqua melafen solutions influences on the parameters of the mice's solid carcinoma Luis development. // In book "The Chemistry and Physics of Engineering Materials, Volume 1 “Modern Analytical Methodologies". // Editors: A.A. Berlin, R. Joswik. Apple Academic Press, 2015 г., Chapter 3.

  2. Alekseeva O.M., Krivandin A.V., Shatalova O.V., Krementsova A.V., Kim Yu.A. Thermodynamic and structural parameters of phospholipid membranes. // In book “Compositional Analysis of Polymers An Engineering Approach. Polimer surfaces and interfaces”. // Editor: M.S. Adaramola, O.V. Stoyanov, G.Zaikov, R.M.Akhmetkhanov, Apple Academic Press, 2015, Chapter 2.   

  3. Н.А. Семенова, Т.А. Ахадов, М.В. Ублинский, С.Д. Варфоломеев. Использование магнитно-резонансной спектроскопии для диагностики и мониторинга лечения неврологических и психических заболеваний. // в монографии «Нейродегенеративные заболевания: от генома до целостного организма», «Научный мир», Москва, 2014 г., глава 1, 16с.

  4. Elena N. Efremenko, Ilya V. Lyagin, Vladimir I. Lozinsky. Enzymatic biocatalysts immobilized on/in the cryogel-type carriers. // In book: "Supermacroporous Cryogels: Biomedical and Biotechnological Applications" (Eds. Ashok Kumar). Boca Raton, USA: CRC Press, Taylor & Francis Group, LLC. 36 pages.

- опубликованные статьи в сборниках трудов:

  1. Алексеева О.М., Кременцова А.В., Фаткуллина Л.Д., Шибряева Л.С., Голощапов А.Н., Ким Ю.А. Действие растворов и эмульсий биологически активных веществ на модели предшественников живых существ. // Сборник трудов X всероссийской школы - конференции молодых ученых "Теоретическая и экспериментальная химия жидкофазных систем" (Крестовские чтения), 26 - 30 октября 2015 г., г. Иваново, РФ, стр. 3-10.
  1. В.Н.Ерохин, В.А.Семёнов, А.В.Кременцова, Е.Б.Бурлакова. Фенольные растительные и синтетические антиоксиданты в профилактике злокачественных новообразований. // Сборник материалов IХ Международного симпозиума «Фенольные соединения: фундаментальные и прикладные аспекты», 2015, Москва, РФ, с. 540-544.
  1. Алексеева О.М., Фаткуллина Л.Д., Кременцова А.В., Голощапов А.Н. Влияние фенозана и его производных на структурные свойства мембран животного происхождения. // Труды IX международной конференции «Биоантиоксидант», 2015 г., Москва, РФ, с. 95-106.
Яндекс.Метрика